52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1185 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  84.31 
 
 		 510 aa  871    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  85.27 
 
 		 509 aa  884    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1032    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 900 aa  74.3  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  29.25 
 
 		 903 aa  73.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 		 871 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.88 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 		 898 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.88 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_002936  DET1621  hypothetical protein  29.68 
 
 		 446 aa  62  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.967511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1503  cell wall/surface repeat protein  29.59 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  25 
 
 		 1619 aa  60.5  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.51 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 		 890 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1367  cell wall/surface repeat-containing protein  28.96 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 		 316 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.89 
 
 		 309 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.46 
 
 		 428 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  26.15 
 
 		 925 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  24.1 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.77 
 
 		 301 aa  51.6  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.74 
 
 		 477 aa  52  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.1 
 
 		 615 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1274 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.45 
 
 		 615 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.13 
 
 		 1343 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0090  hypothetical protein  28.05 
 
 		 860 aa  50.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000863747 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0119  hypothetical protein  25.3 
 
 		 901 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.28 
 
 		 469 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.41 
 
 		 1196 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1873  hypothetical protein  29.46 
 
 		 603 aa  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.505982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.17 
 
 		 322 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  27.33 
 
 		 293 aa  47  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.43 
 
 		 324 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.48 
 
 		 1004 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.5 
 
 		 590 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.39 
 
 		 538 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.74 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  26.39 
 
 		 276 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  33.9 
 
 		 1390 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 629 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.57 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 718 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.56 
 
 		 561 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0488  Legumain  27.18 
 
 		 726 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  27.18 
 
 		 500 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1462  hypothetical protein  28.3 
 
 		 689 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.947543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.87 
 
 		 265 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.33 
 
 		 713 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.5 
 
 		 708 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.34 
 
 		 355 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0337671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>