113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2399 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  100 
 
 
276 aa  570  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.44 
 
 
502 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.2 
 
 
481 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38 
 
 
554 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.09 
 
 
489 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  36.89 
 
 
576 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.34 
 
 
486 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  36.43 
 
 
971 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.43 
 
 
971 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.1 
 
 
649 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.25 
 
 
485 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.24 
 
 
421 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.81 
 
 
445 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  35.16 
 
 
477 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.59 
 
 
478 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  37.34 
 
 
499 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.97 
 
 
515 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.03 
 
 
766 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  35.86 
 
 
486 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.07 
 
 
490 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.06 
 
 
291 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.99 
 
 
859 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.95 
 
 
504 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.55 
 
 
485 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.95 
 
 
860 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.5 
 
 
495 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  30.43 
 
 
449 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.45 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.84 
 
 
522 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  33.87 
 
 
518 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.36 
 
 
474 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.79 
 
 
718 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  31.78 
 
 
287 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  30.83 
 
 
527 aa  129  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.19 
 
 
479 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.54 
 
 
839 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.91 
 
 
778 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 
713 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 
528 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.08 
 
 
288 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.93 
 
 
541 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.57 
 
 
472 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.61 
 
 
680 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.08 
 
 
728 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.46 
 
 
553 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.64 
 
 
629 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  30.92 
 
 
654 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  31.47 
 
 
619 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.92 
 
 
818 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.09 
 
 
1155 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.9 
 
 
708 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.5 
 
 
784 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  31.06 
 
 
616 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.69 
 
 
1056 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.52 
 
 
479 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  30.4 
 
 
657 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.51 
 
 
511 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.99 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.48 
 
 
828 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.5 
 
 
988 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  28.76 
 
 
523 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.65 
 
 
1026 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.6 
 
 
292 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.8 
 
 
813 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.42 
 
 
1056 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.12 
 
 
289 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  27.02 
 
 
798 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  28.71 
 
 
500 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.65 
 
 
915 aa  102  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.99 
 
 
1022 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.39 
 
 
776 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  27.92 
 
 
570 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.94 
 
 
862 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.55 
 
 
824 aa  95.9  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  27.34 
 
 
472 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.35 
 
 
499 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  27.6 
 
 
482 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  26.23 
 
 
535 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.03 
 
 
502 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.81 
 
 
501 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.36 
 
 
652 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.49 
 
 
497 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.68 
 
 
798 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  27.92 
 
 
781 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.54 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.13 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.52 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  26.86 
 
 
636 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  24.86 
 
 
925 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.33 
 
 
570 aa  59.3  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.18 
 
 
652 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530037  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  28.67 
 
 
670 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  25.42 
 
 
328 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.2 
 
 
324 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.16 
 
 
1196 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  27.78 
 
 
510 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.9 
 
 
316 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  26.21 
 
 
331 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  26.39 
 
 
509 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.76 
 
 
464 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>