99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0899 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  59.81 
 
 		 708 aa  709    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  83.57 
 
 		 718 aa  1109    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 713 aa  1421    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  54.75 
 
 		 495 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  48.46 
 
 		 479 aa  343  8e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  54.07 
 
 		 619 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  51.84 
 
 		 1056 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  52.05 
 
 		 818 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  52.67 
 
 		 784 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  54.19 
 
 		 1056 aa  251  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  51.64 
 
 		 988 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  52.94 
 
 		 778 aa  248  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  53.71 
 
 		 1022 aa  247  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  50.64 
 
 		 839 aa  243  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.6 
 
 		 629 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  38.3 
 
 		 477 aa  183  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  36.45 
 
 		 486 aa  178  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  29.87 
 
 		 499 aa  173  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.73 
 
 		 859 aa  173  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.98 
 
 		 860 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.24 
 
 		 490 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.05 
 
 		 502 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  40.23 
 
 		 449 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  36.73 
 
 		 576 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.78 
 
 		 680 aa  153  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.4 
 
 		 445 aa  151  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.86 
 
 		 472 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.26 
 
 		 515 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.44 
 
 		 554 aa  146  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.49 
 
 		 478 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.66 
 
 		 971 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.4 
 
 		 728 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.99 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  35.66 
 
 		 971 aa  146  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.49 
 
 		 1155 aa  145  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.78 
 
 		 489 aa  140  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.76 
 
 		 481 aa  134  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.53 
 
 		 649 aa  134  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  35.83 
 
 		 472 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.68 
 
 		 652 aa  125  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  31.58 
 
 		 276 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.62 
 
 		 486 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.07 
 
 		 766 aa  118  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  32.16 
 
 		 527 aa  117  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.15 
 
 		 862 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.75 
 
 		 1026 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.95 
 
 		 501 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 		 528 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.56 
 
 		 499 aa  108  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 541 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.82 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.76 
 
 		 828 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 		 504 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  27.15 
 
 		 798 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.59 
 
 		 915 aa  104  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.8 
 
 		 295 aa  104  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  29.74 
 
 		 518 aa  103  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.34 
 
 		 813 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.3 
 
 		 522 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  29.3 
 
 		 500 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.68 
 
 		 776 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  31.1 
 
 		 482 aa  101  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 		 502 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.45 
 
 		 292 aa  98.2  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  28.45 
 
 		 657 aa  97.4  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.45 
 
 		 511 aa  97.4  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.26 
 
 		 497 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.67 
 
 		 553 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.02 
 
 		 479 aa  94.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.39 
 
 		 291 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.72 
 
 		 397 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.02 
 
 		 474 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.87 
 
 		 442 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 		 824 aa  90.9  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  30 
 
 		 523 aa  90.1  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  27.88 
 
 		 654 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.39 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.87 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.28 
 
 		 798 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  26.5 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.63 
 
 		 289 aa  76.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  28 
 
 		 570 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  27.71 
 
 		 535 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  29.79 
 
 		 616 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  28.24 
 
 		 925 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.14 
 
 		 652 aa  62.4  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530037  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  31.19 
 
 		 544 aa  59.3  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.34 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  26.85 
 
 		 902 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.22 
 
 		 1196 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.32 
 
 		 2050 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103248 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.65 
 
 		 324 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  27.41 
 
 		 331 aa  48.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1470  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.63 
 
 		 753 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.36 
 
 		 316 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  28.21 
 
 		 328 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3999  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.59 
 
 		 568 aa  45.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.121283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>