103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0722 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
324 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  62.15 
 
 
324 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  64.65 
 
 
331 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  51.84 
 
 
322 aa  344  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  46.88 
 
 
316 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  44.82 
 
 
328 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.38 
 
 
316 aa  261  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13750  Caspase domain-containing protein  40.24 
 
 
325 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.843399  normal  0.836871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0189  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.88 
 
 
313 aa  215  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0201  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.61 
 
 
325 aa  189  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0418553  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.42 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  30.38 
 
 
1553 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.91 
 
 
1240 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.1 
 
 
1557 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.79 
 
 
1481 aa  62.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.79 
 
 
1760 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.36 
 
 
499 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.31 
 
 
1711 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.37 
 
 
1196 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  25.57 
 
 
902 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  27.44 
 
 
500 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  26.22 
 
 
576 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.34 
 
 
1088 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.36 
 
 
502 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.12 
 
 
830 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  24.78 
 
 
900 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.87 
 
 
658 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.17 
 
 
1686 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.1 
 
 
579 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.12 
 
 
497 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.92 
 
 
501 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.88 
 
 
495 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  25.43 
 
 
903 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
654 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  27.86 
 
 
925 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.91 
 
 
397 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.99 
 
 
479 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.1 
 
 
578 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.1 
 
 
578 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.75 
 
 
515 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  30.83 
 
 
442 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.99 
 
 
1203 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3011  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.64 
 
 
466 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.912982  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.71 
 
 
261 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
729 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.83 
 
 
428 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.75 
 
 
478 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.89 
 
 
1004 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  28.22 
 
 
587 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.38 
 
 
292 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  24.02 
 
 
510 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  25.65 
 
 
890 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.06 
 
 
485 aa  49.7  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  25.63 
 
 
1619 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  29.95 
 
 
1510 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  27.21 
 
 
420 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.64 
 
 
295 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.1 
 
 
442 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3116  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.23 
 
 
557 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  24.43 
 
 
509 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.45 
 
 
907 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  30.92 
 
 
609 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.43 
 
 
1274 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  25.32 
 
 
499 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.22 
 
 
941 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.66 
 
 
485 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.52 
 
 
795 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
289 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.1 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.92 
 
 
612 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.52 
 
 
795 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.66 
 
 
728 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.44 
 
 
1316 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  25.91 
 
 
781 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.28 
 
 
708 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.36 
 
 
486 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  24.87 
 
 
898 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  23.43 
 
 
509 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.99 
 
 
718 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  23.79 
 
 
783 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.16 
 
 
298 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  23.74 
 
 
670 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  26.8 
 
 
463 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.71 
 
 
708 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.81 
 
 
1106 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.87 
 
 
629 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  23.83 
 
 
871 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  23.76 
 
 
636 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.15 
 
 
481 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 
477 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.1 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  24.32 
 
 
1097 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5166  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.76 
 
 
1494 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 
489 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.55 
 
 
680 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.25 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 
902 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.65 
 
 
704 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.6 
 
 
704 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.69 
 
 
590 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>