243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2005 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 477 aa  989    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.04 
 
 		 590 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  37.85 
 
 		 871 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 898 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  33.88 
 
 		 903 aa  107  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  33.47 
 
 		 900 aa  106  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 890 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 658 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 		 499 aa  83.6  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.9 
 
 		 501 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.73 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  30.26 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  29.22 
 
 		 576 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.46 
 
 		 778 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  31.3 
 
 		 536 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  60.78 
 
 		 784 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.74 
 
 		 497 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.5 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.45 
 
 		 860 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.73 
 
 		 859 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4531  S-layer region-like  27.72 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.57 
 
 		 718 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.87 
 
 		 1316 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.7 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.54 
 
 		 766 aa  60.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.64 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 		 713 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  31.05 
 
 		 587 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.71 
 
 		 511 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.85 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.44 
 
 		 839 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.94 
 
 		 1343 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  26.44 
 
 		 921 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  26.88 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.98 
 
 		 1196 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.18 
 
 		 798 aa  57  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  28.37 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.82 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  31.06 
 
 		 506 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  33.62 
 
 		 526 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.21 
 
 		 1056 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.05 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.19 
 
 		 495 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.16 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  29.55 
 
 		 629 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.55 
 
 		 291 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  29.17 
 
 		 1821 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.9 
 
 		 316 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.01 
 
 		 485 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.78 
 
 		 478 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.07 
 
 		 6885 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  34.13 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  32.22 
 
 		 631 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.14 
 
 		 479 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.81 
 
 		 818 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.15 
 
 		 295 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 1155 aa  54.3  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.26 
 
 		 309 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.86 
 
 		 491 aa  53.9  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.79 
 
 		 657 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0721  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.19 
 
 		 696 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.64 
 
 		 486 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  25.53 
 
 		 510 aa  53.9  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.11 
 
 		 629 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.71 
 
 		 728 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  32.38 
 
 		 518 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.79 
 
 		 457 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.37 
 
 		 421 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  27.61 
 
 		 925 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  31.39 
 
 		 328 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  32.21 
 
 		 548 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  26.84 
 
 		 506 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  26.7 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.79 
 
 		 515 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1179  S-layer domain protein  26.92 
 
 		 218 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165051  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 708 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  27.74 
 
 		 509 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.79 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 538 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.5 
 
 		 649 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 538 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.21 
 
 		 324 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1023  S-layer protein  28.74 
 
 		 218 aa  52  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.87 
 
 		 278 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  27.92 
 
 		 1226 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  27.31 
 
 		 654 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  42.47 
 
 		 616 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1075  S-layer-like domain-containing protein  26.14 
 
 		 376 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3027  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.41 
 
 		 697 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438464  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  30.16 
 
 		 477 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  41.18 
 
 		 1036 aa  50.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  29.61 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1194 aa  50.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.43 
 
 		 554 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  30.77 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.61 
 
 		 988 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  27.86 
 
 		 431 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  27.94 
 
 		 783 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>