47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7210 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  91.26 
 
 		 538 aa  954    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 538 aa  1075    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.97 
 
 		 561 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0281  hypothetical protein  35.29 
 
 		 280 aa  124  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  29.94 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.97 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.46 
 
 		 1316 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.28 
 
 		 615 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.06 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.62 
 
 		 305 aa  57  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 		 615 aa  57  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.42 
 
 		 850 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1383  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.68 
 
 		 431 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 302 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.92 
 
 		 907 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  30.77 
 
 		 277 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.13 
 
 		 562 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.63 
 
 		 729 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 		 309 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.2 
 
 		 261 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.04 
 
 		 355 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.77 
 
 		 979 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  23.26 
 
 		 890 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  25.62 
 
 		 509 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.69 
 
 		 633 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 		 898 aa  49.7  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  25 
 
 		 378 aa  48.5  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  25 
 
 		 438 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.54 
 
 		 285 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.29 
 
 		 457 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.58 
 
 		 275 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 		 578 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 		 578 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 		 579 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 671 aa  47  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  23.03 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  22.73 
 
 		 871 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  25 
 
 		 509 aa  47  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.17 
 
 		 298 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.71 
 
 		 501 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.56 
 
 		 343 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 393 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.33 
 
 		 590 aa  44.3  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0189  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 313 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0523  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.93 
 
 		 648 aa  43.5  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>