63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0189 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0189  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 313 aa  641    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13750  Caspase domain-containing protein  60 
 
 		 325 aa  381  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.843399  normal  0.836871 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.21 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  40.73 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.69 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.08 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.38 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.88 
 
 		 324 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0201  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.61 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0418553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  38.23 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  30.77 
 
 		 587 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5166  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.18 
 
 		 1494 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.23 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  27.65 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 871 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.48 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.91 
 
 		 658 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.26 
 
 		 1316 aa  52.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.39 
 
 		 1686 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.82 
 
 		 1004 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  28.79 
 
 		 499 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.77 
 
 		 1004 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.53 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.11 
 
 		 1557 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.23 
 
 		 515 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 		 1760 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  29.68 
 
 		 898 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3830  WD-40 repeat protein  27.18 
 
 		 709 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171146  normal  0.119084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  27.89 
 
 		 576 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.46 
 
 		 478 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.27 
 
 		 1196 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  26.97 
 
 		 890 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.85 
 
 		 1553 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  28.33 
 
 		 900 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.65 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.71 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.93 
 
 		 666 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.13 
 
 		 1481 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.83 
 
 		 830 aa  45.8  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2362  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.79 
 
 		 630 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3611  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.19 
 
 		 649 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  28.33 
 
 		 903 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.89 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.13 
 
 		 485 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  27.91 
 
 		 654 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  23.56 
 
 		 902 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.34 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3011  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.912982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.56 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.23 
 
 		 629 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.46 
 
 		 477 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 538 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.38 
 
 		 445 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  27.33 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  27.67 
 
 		 540 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  29.3 
 
 		 449 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.67 
 
 		 1510 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.53 
 
 		 445 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.88 
 
 		 445 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.61 
 
 		 652 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.68 
 
 		 481 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.16 
 
 		 491 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>