More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3830 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3830  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 709 aa  1432    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171146  normal  0.119084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  44.96 
 
 		 652 aa  186  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.77 
 
 		 682 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.16 
 
 		 716 aa  153  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  45.15 
 
 		 1344 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.84 
 
 		 737 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  35.99 
 
 		 540 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  34.89 
 
 		 461 aa  137  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.99 
 
 		 833 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 1221 aa  134  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.61 
 
 		 828 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  36.14 
 
 		 1334 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  37.72 
 
 		 696 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.72 
 
 		 865 aa  127  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.7 
 
 		 806 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  32.05 
 
 		 405 aa  124  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.07 
 
 		 1557 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  30.75 
 
 		 1236 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  31.48 
 
 		 947 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  33.44 
 
 		 1364 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  35.26 
 
 		 1357 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  31.8 
 
 		 1878 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  30.84 
 
 		 1163 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.12 
 
 		 676 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  35.31 
 
 		 1355 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  32.17 
 
 		 1196 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.75 
 
 		 1363 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  37.25 
 
 		 1217 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  32.64 
 
 		 1443 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.84 
 
 		 740 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.02 
 
 		 757 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.15 
 
 		 919 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.63 
 
 		 1652 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  28.95 
 
 		 1474 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  32.7 
 
 		 1657 aa  109  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.02 
 
 		 630 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.82 
 
 		 1240 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.97 
 
 		 1686 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  32.06 
 
 		 742 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.56 
 
 		 576 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  34.47 
 
 		 790 aa  104  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.85 
 
 		 682 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  29.73 
 
 		 1247 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.91 
 
 		 1193 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.44 
 
 		 675 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.23 
 
 		 664 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.15 
 
 		 924 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.8 
 
 		 1190 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  29.19 
 
 		 1190 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.56 
 
 		 898 aa  100  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  30.83 
 
 		 1188 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  29.57 
 
 		 1230 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  30.94 
 
 		 608 aa  99.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.97 
 
 		 692 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  30.83 
 
 		 1858 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.84 
 
 		 729 aa  99  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  32.17 
 
 		 437 aa  98.2  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.24 
 
 		 677 aa  97.8  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  30.18 
 
 		 1491 aa  97.8  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01270  cytoplasm protein, putative  31.38 
 
 		 314 aa  97.8  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00000980241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 1188 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.29 
 
 		 1553 aa  97.4  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  30.31 
 
 		 434 aa  96.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  27.72 
 
 		 1348 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  29.46 
 
 		 443 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1807 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.91 
 
 		 698 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.3 
 
 		 930 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2529  WD-40 repeat protein  38.07 
 
 		 248 aa  96.3  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00110539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.31 
 
 		 1656 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.07 
 
 		 642 aa  95.5  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  25.67 
 
 		 687 aa  95.1  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  30.18 
 
 		 1208 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.37 
 
 		 1262 aa  94.7  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  28.14 
 
 		 1264 aa  94  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  28.14 
 
 		 1264 aa  94  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  32.21 
 
 		 1265 aa  94  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.98 
 
 		 835 aa  94  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.33 
 
 		 1901 aa  93.6  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.91 
 
 		 344 aa  93.2  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.48 
 
 		 1760 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  28.71 
 
 		 464 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1401 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  29.25 
 
 		 344 aa  93.2  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 		 577 aa  93.2  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.1 
 
 		 1583 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  30.62 
 
 		 565 aa  92.8  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.97 
 
 		 1711 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.63 
 
 		 1789 aa  92  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  27.15 
 
 		 1311 aa  91.7  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  33.96 
 
 		 335 aa  91.7  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.52 
 
 		 1481 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  26.02 
 
 		 578 aa  91.3  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.1 
 
 		 1607 aa  91.3  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 1161 aa  90.9  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.6 
 
 		 1211 aa  90.9  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.67 
 
 		 608 aa  90.9  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 		 954 aa  90.5  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  30.16 
 
 		 1661 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.06 
 
 		 1367 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>