105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4384 on replicon NC_009661
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
324 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  62.15 
 
 
324 aa  431  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  56.19 
 
 
331 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  51.85 
 
 
322 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  49.23 
 
 
316 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  45.02 
 
 
328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.68 
 
 
316 aa  266  5e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13750  Caspase domain-containing protein  39.94 
 
 
325 aa  242  5e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.843399  normal  0.836871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0189  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.69 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0201  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.73 
 
 
325 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0418553  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29.24 
 
 
1553 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.82 
 
 
658 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 
900 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.21 
 
 
1760 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.6 
 
 
1481 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  30.74 
 
 
871 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  28.69 
 
 
903 aa  67  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 
1686 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.97 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  26.78 
 
 
898 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.62 
 
 
1196 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.99 
 
 
1240 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.68 
 
 
1711 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.02 
 
 
1088 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
654 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  29.47 
 
 
925 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.24 
 
 
1557 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  27.78 
 
 
1619 aa  59.3  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.53 
 
 
941 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  27.59 
 
 
636 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  26.96 
 
 
890 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  25.12 
 
 
781 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.43 
 
 
485 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3011  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.85 
 
 
466 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.912982  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.37 
 
 
718 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.7 
 
 
902 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.57 
 
 
479 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.91 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.29 
 
 
495 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.7 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.79 
 
 
457 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.66 
 
 
680 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  24.62 
 
 
902 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.58 
 
 
499 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  24.64 
 
 
500 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  26.19 
 
 
587 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  27.74 
 
 
576 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.05 
 
 
728 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.09 
 
 
708 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.15 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.21 
 
 
477 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.19 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  25.84 
 
 
509 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3611  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.56 
 
 
649 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 
729 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.93 
 
 
478 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.17 
 
 
1510 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.65 
 
 
501 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.01 
 
 
830 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.54 
 
 
515 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.25 
 
 
421 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  22.52 
 
 
783 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  25.55 
 
 
499 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.46 
 
 
489 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  24.47 
 
 
664 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  28.87 
 
 
449 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.95 
 
 
481 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  29.79 
 
 
442 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.78 
 
 
469 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.93 
 
 
486 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  29.2 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2362  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 
630 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.65 
 
 
713 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.65 
 
 
502 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  28.38 
 
 
1097 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.59 
 
 
1274 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.34 
 
 
485 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.46 
 
 
629 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  30.66 
 
 
486 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.09 
 
 
1316 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.79 
 
 
1106 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.12 
 
 
1004 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.29 
 
 
795 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.29 
 
 
795 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 
428 aa  46.6  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.87 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  23.38 
 
 
670 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0014  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.88 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3116  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.35 
 
 
557 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.5 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5166  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.8 
 
 
1494 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4216  integral membrane protein-like  35.94 
 
 
607 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  28.47 
 
 
477 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1503  diguanylate phosphodiesterase  26.03 
 
 
731 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.293201  hitchhiker  0.000197979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.38 
 
 
1203 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  28.78 
 
 
657 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
511 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0361  Clp domain-containing protein  30.26 
 
 
765 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.722952  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  25.9 
 
 
287 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.84 
 
 
711 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>