89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3616 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  677    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  46.65 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  45.02 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.82 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13750  Caspase domain-containing protein  41.57 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.843399  normal  0.836871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.52 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0189  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.73 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  41.07 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.18 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0201  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.01 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0418553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  30.13 
 
 		 587 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.23 
 
 		 1196 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  30.29 
 
 		 1553 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  28.75 
 
 		 902 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3011  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.912982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.77 
 
 		 1557 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.06 
 
 		 1481 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.97 
 
 		 1240 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.23 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.23 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.61 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.25 
 
 		 1686 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 907 aa  56.2  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.64 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  26.61 
 
 		 770 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 890 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  26.5 
 
 		 442 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.73 
 
 		 615 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.96 
 
 		 658 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.66 
 
 		 1760 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  27.5 
 
 		 925 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.47 
 
 		 464 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.39 
 
 		 477 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.05 
 
 		 615 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.64 
 
 		 1088 aa  52.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.68 
 
 		 428 aa  52.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.81 
 
 		 1203 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 298 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  29.59 
 
 		 499 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1510 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.58 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.51 
 
 		 784 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  28.71 
 
 		 781 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.58 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 478 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.43 
 
 		 479 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  25.76 
 
 		 1619 aa  50.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.18 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  25.42 
 
 		 276 aa  50.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 		 1004 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.1 
 
 		 515 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.51 
 
 		 818 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.13 
 
 		 485 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26 
 
 		 590 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.25 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1097 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.24 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  28.72 
 
 		 576 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.04 
 
 		 1056 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5561  hypothetical protein  26.94 
 
 		 619 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.27855e-47 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.34 
 
 		 355 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.53 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 275 aa  46.2  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5166  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.04 
 
 		 1494 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.06 
 
 		 485 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.21 
 
 		 713 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6789  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.8 
 
 		 1554 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  28.68 
 
 		 616 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.55 
 
 		 708 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.7 
 
 		 479 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.04 
 
 		 988 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.11 
 
 		 1711 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.13 
 
 		 830 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.18 
 
 		 718 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.49 
 
 		 729 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.04 
 
 		 1022 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.4 
 
 		 1056 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.91 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.12 
 
 		 629 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.28 
 
 		 1316 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.84 
 
 		 657 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.68 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 		 649 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.39 
 
 		 554 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3830  WD-40 repeat protein  27.55 
 
 		 709 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171146  normal  0.119084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.25 
 
 		 652 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.43 
 
 		 915 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.8 
 
 		 680 aa  42.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.800014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>