97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0752 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 479 aa  983    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.18 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.15 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.86 
 
 		 502 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  38.17 
 
 		 576 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  37.64 
 
 		 499 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.68 
 
 		 495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.76 
 
 		 481 aa  120  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.98 
 
 		 839 aa  117  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.62 
 
 		 489 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.08 
 
 		 485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.01 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.69 
 
 		 554 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.27 
 
 		 778 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.48 
 
 		 486 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  32.52 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  34.8 
 
 		 486 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  33.58 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.21 
 
 		 818 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.8 
 
 		 728 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.37 
 
 		 680 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.15 
 
 		 1022 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34 
 
 		 1155 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.14 
 
 		 629 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.8 
 
 		 988 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.98 
 
 		 652 aa  105  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.32 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.74 
 
 		 1056 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.39 
 
 		 784 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.47 
 
 		 490 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35 
 
 		 649 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.2 
 
 		 1056 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.62 
 
 		 860 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.31 
 
 		 445 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.25 
 
 		 859 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.82 
 
 		 472 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.97 
 
 		 713 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.74 
 
 		 718 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.64 
 
 		 499 aa  93.2  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  36.61 
 
 		 619 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.45 
 
 		 501 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.89 
 
 		 497 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.94 
 
 		 971 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  30.94 
 
 		 971 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.02 
 
 		 502 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  30.92 
 
 		 500 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 		 291 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  29.31 
 
 		 449 aa  87.8  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.01 
 
 		 824 aa  87  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.84 
 
 		 915 aa  87  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.54 
 
 		 708 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.4 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.54 
 
 		 1026 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 		 511 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  31.37 
 
 		 482 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.25 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.9 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.32 
 
 		 570 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  29.79 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.13 
 
 		 862 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  26.61 
 
 		 518 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.09 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.45 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.27 
 
 		 541 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  32.33 
 
 		 616 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.35 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.3 
 
 		 776 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  32.76 
 
 		 798 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  26.64 
 
 		 287 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  26.05 
 
 		 527 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.72 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.62 
 
 		 766 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.63 
 
 		 813 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  27 
 
 		 654 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.12 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  26.14 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  25.97 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 		 798 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.81 
 
 		 828 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.1 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.51 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  28.45 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  25.93 
 
 		 570 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.24 
 
 		 553 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  25.82 
 
 		 557 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.03 
 
 		 658 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.87 
 
 		 1196 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  27.03 
 
 		 925 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  33.63 
 
 		 137 aa  47.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  26.7 
 
 		 328 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.34 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.8 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.62 
 
 		 278 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.24 
 
 		 1344 aa  44.3  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  42.11 
 
 		 685 aa  43.5  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>