269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2462 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
649 aa  1271    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.14 
 
 
859 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.21 
 
 
860 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.32 
 
 
485 aa  162  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  36.21 
 
 
276 aa  161  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  34.88 
 
 
486 aa  160  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.02 
 
 
680 aa  160  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.14 
 
 
728 aa  160  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  38.94 
 
 
576 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.09 
 
 
502 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.4 
 
 
1155 aa  154  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.45 
 
 
486 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  33.65 
 
 
477 aa  154  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.49 
 
 
515 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.55 
 
 
481 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.27 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.27 
 
 
478 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  35.17 
 
 
619 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.95 
 
 
421 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.11 
 
 
971 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  37.11 
 
 
971 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  39.83 
 
 
499 aa  144  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.45 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.22 
 
 
554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.57 
 
 
490 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.88 
 
 
718 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.05 
 
 
766 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.08 
 
 
445 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.91 
 
 
713 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.62 
 
 
479 aa  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.71 
 
 
495 aa  135  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.21 
 
 
708 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  37.35 
 
 
449 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.22 
 
 
818 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.17 
 
 
1056 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.53 
 
 
629 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.93 
 
 
472 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.73 
 
 
784 aa  123  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.77 
 
 
988 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.67 
 
 
1022 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.09 
 
 
778 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.9 
 
 
862 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.32 
 
 
1056 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.18 
 
 
839 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  31.6 
 
 
654 aa  115  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  32.2 
 
 
657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.97 
 
 
1026 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.32 
 
 
828 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.64 
 
 
479 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.51 
 
 
511 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.44 
 
 
652 aa  101  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.91 
 
 
501 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.4 
 
 
504 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.4 
 
 
915 aa  100  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  30.14 
 
 
798 aa  99.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  31.89 
 
 
527 aa  98.6  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  34.18 
 
 
616 aa  98.2  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.11 
 
 
813 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.54 
 
 
502 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.31 
 
 
528 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  29.53 
 
 
500 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  29.82 
 
 
518 aa  95.5  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.54 
 
 
499 aa  93.6  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.35 
 
 
522 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.83 
 
 
474 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.37 
 
 
824 aa  91.3  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  33.82 
 
 
482 aa  90.5  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.3 
 
 
776 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.83 
 
 
541 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.08 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  31.94 
 
 
523 aa  84.7  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.98 
 
 
553 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.98 
 
 
292 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  27.96 
 
 
684 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.99 
 
 
397 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.76 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.21 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.82 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.46 
 
 
490 aa  80.9  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.74 
 
 
570 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  28.92 
 
 
472 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  26.81 
 
 
287 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.75 
 
 
490 aa  78.2  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.19 
 
 
789 aa  77.4  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2511  Sel1-like protein  36.36 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.36 
 
 
289 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.7 
 
 
288 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.48 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  30.32 
 
 
535 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.18 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00795685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  33.11 
 
 
489 aa  74.3  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.52 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0721  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.18 
 
 
696 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  37.58 
 
 
234 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  29.1 
 
 
961 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3437  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.95 
 
 
278 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  38.1 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  28.95 
 
 
570 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3027  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.54 
 
 
697 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438464  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  30.61 
 
 
831 aa  71.6  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>