117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5464 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  100 
 
 
499 aa  1001    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  62.3 
 
 
478 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  62.02 
 
 
515 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  62.26 
 
 
485 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  62.04 
 
 
485 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  43.4 
 
 
576 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.25 
 
 
915 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.5 
 
 
824 aa  193  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35 
 
 
1026 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  45.18 
 
 
502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.96 
 
 
862 aa  186  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.11 
 
 
554 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.68 
 
 
718 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.26 
 
 
776 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.92 
 
 
421 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  31.59 
 
 
798 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.62 
 
 
713 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.27 
 
 
445 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.04 
 
 
481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.68 
 
 
828 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  42.86 
 
 
449 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.63 
 
 
472 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.78 
 
 
859 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.4 
 
 
813 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  37.55 
 
 
971 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.85 
 
 
860 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.95 
 
 
489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.13 
 
 
971 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.05 
 
 
680 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.98 
 
 
479 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.29 
 
 
495 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  40.17 
 
 
486 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  39.74 
 
 
619 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.15 
 
 
728 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30 
 
 
708 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.61 
 
 
486 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.66 
 
 
778 aa  153  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  38.33 
 
 
477 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.26 
 
 
629 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  37.34 
 
 
276 aa  146  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.17 
 
 
818 aa  146  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40.09 
 
 
649 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.71 
 
 
988 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.15 
 
 
1056 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.47 
 
 
474 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.66 
 
 
1155 aa  141  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.9 
 
 
784 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.39 
 
 
528 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.7 
 
 
766 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.17 
 
 
839 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.43 
 
 
541 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  37.02 
 
 
518 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.53 
 
 
295 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.37 
 
 
504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.59 
 
 
490 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  36.09 
 
 
527 aa  134  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.4 
 
 
1056 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.95 
 
 
1022 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.45 
 
 
289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.22 
 
 
292 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.71 
 
 
291 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  34.02 
 
 
287 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.16 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.26 
 
 
479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  33.04 
 
 
570 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  28.45 
 
 
654 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  32 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  31.78 
 
 
535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  28.39 
 
 
657 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.32 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  31.33 
 
 
523 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.09 
 
 
499 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  30.4 
 
 
500 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.55 
 
 
553 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.74 
 
 
501 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  33.47 
 
 
616 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  33.65 
 
 
482 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.51 
 
 
522 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.19 
 
 
511 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.65 
 
 
502 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
652 aa  96.7  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.74 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.86 
 
 
397 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.9 
 
 
497 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.49 
 
 
570 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.16 
 
 
798 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  25.65 
 
 
781 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1961  hypothetical protein  30.91 
 
 
502 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.159443  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.44 
 
 
1557 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.81 
 
 
1088 aa  53.9  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  23.83 
 
 
925 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  31.91 
 
 
900 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
890 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  26.57 
 
 
654 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
830 aa  51.2  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  31.54 
 
 
898 aa  51.2  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  27.4 
 
 
636 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.68 
 
 
322 aa  51.2  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  29.59 
 
 
328 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.35 
 
 
1196 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>