45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3011 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3011  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 466 aa  963    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.912982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.92 
 
 		 1686 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.28 
 
 		 1760 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.43 
 
 		 795 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.43 
 
 		 795 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  24.64 
 
 		 871 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.41 
 
 		 658 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.51 
 
 		 1711 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  26.44 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.31 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  27.13 
 
 		 781 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  24.58 
 
 		 654 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.09 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.12 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  25.66 
 
 		 925 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.85 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1097 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3116  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.07 
 
 		 557 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 890 aa  53.9  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  25.71 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.74 
 
 		 316 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.64 
 
 		 324 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0201  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.79 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0418553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  23.62 
 
 		 898 aa  52  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 		 1672 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.91 
 
 		 445 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.61 
 
 		 657 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13750  Caspase domain-containing protein  26.18 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.843399  normal  0.836871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.83 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  23.31 
 
 		 587 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.58 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.4 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  21.05 
 
 		 900 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.12 
 
 		 830 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.75 
 
 		 464 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.46 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  28 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  21.32 
 
 		 903 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  35.11 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2362  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.04 
 
 		 630 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0189  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 		 313 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.03 
 
 		 301 aa  43.9  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.93 
 
 		 1240 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.48 
 
 		 270 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>