35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3116 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3116  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 557 aa  1104    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39 
 
 		 704 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39 
 
 		 704 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.96 
 
 		 735 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.85 
 
 		 708 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 		 925 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  26.52 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  25.81 
 
 		 900 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.18 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  25.45 
 
 		 903 aa  61.6  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3011  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.88 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.912982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.13 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.49 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 		 871 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.83 
 
 		 261 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.11 
 
 		 578 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.23 
 
 		 579 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.11 
 
 		 578 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.42 
 
 		 1686 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 		 898 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.38 
 
 		 1760 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.11 
 
 		 316 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.17 
 
 		 324 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.04 
 
 		 278 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  25.49 
 
 		 890 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.88 
 
 		 1203 aa  48.9  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  28.16 
 
 		 331 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.14 
 
 		 1711 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  20.91 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.18 
 
 		 902 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.35 
 
 		 324 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.51 
 
 		 941 aa  45.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  22.89 
 
 		 1097 aa  44.3  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.85 
 
 		 1162 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 		 316 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>