42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1608 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 735 aa  1458    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.22 
 
 		 704 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.92 
 
 		 704 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.86 
 
 		 708 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3116  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.21 
 
 		 557 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3939  hypothetical protein  31.17 
 
 		 649 aa  147  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462657  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4789  hypothetical protein  28.41 
 
 		 587 aa  146  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0838792  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1930  hypothetical protein  33.98 
 
 		 595 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  0.0291599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5660  hypothetical protein  30 
 
 		 588 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0874  ICE-like protease  35.06 
 
 		 360 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00749471  normal  0.127131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3567  hypothetical protein  32.99 
 
 		 575 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.336155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2373  hypothetical protein  37.29 
 
 		 619 aa  114  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.651768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3564  hypothetical protein  31.23 
 
 		 572 aa  110  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1935  hypothetical protein  26.6 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5664  hypothetical protein  29.84 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2831  hypothetical protein  28.44 
 
 		 605 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.37 
 
 		 393 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.88 
 
 		 579 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.3 
 
 		 578 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.88 
 
 		 578 aa  68.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.16 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  29.2 
 
 		 925 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.19 
 
 		 1203 aa  58.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0647  hypothetical protein  31.16 
 
 		 166 aa  57  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0138679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.17 
 
 		 1106 aa  56.2  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  23.51 
 
 		 587 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.46 
 
 		 1088 aa  52  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.46 
 
 		 1711 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.58 
 
 		 1196 aa  49.7  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.4 
 
 		 445 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  20.42 
 
 		 442 aa  50.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.4 
 
 		 445 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.59 
 
 		 941 aa  48.5  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  25.89 
 
 		 900 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.95 
 
 		 1760 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.61 
 
 		 1686 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1503  diguanylate phosphodiesterase  25.55 
 
 		 731 aa  45.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.293201  hitchhiker  0.000197979 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.29 
 
 		 902 aa  45.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1433  hypothetical protein  31.54 
 
 		 201 aa  44.7  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.59 
 
 		 795 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.62 
 
 		 428 aa  44.3  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.97 
 
 		 830 aa  44.3  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>