47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0979 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
704 aa  1344    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  98.86 
 
 
704 aa  1328    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  60.06 
 
 
708 aa  734    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.1 
 
 
735 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0874  ICE-like protease  41.24 
 
 
360 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00749471  normal  0.127131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3116  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.93 
 
 
557 aa  181  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1930  hypothetical protein  27.98 
 
 
595 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  0.0291599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3567  hypothetical protein  26.82 
 
 
575 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.336155  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3939  hypothetical protein  25.78 
 
 
649 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462657  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4789  hypothetical protein  26.33 
 
 
587 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0838792  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3564  hypothetical protein  26.52 
 
 
572 aa  97.4  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5660  hypothetical protein  25.98 
 
 
588 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.75 
 
 
578 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  31.51 
 
 
925 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.64 
 
 
578 aa  73.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.82 
 
 
579 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2373  hypothetical protein  27.98 
 
 
619 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.651768  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2831  hypothetical protein  28.57 
 
 
605 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5664  hypothetical protein  24.86 
 
 
382 aa  64.3  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.51 
 
 
445 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.65 
 
 
1686 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.51 
 
 
445 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1935  hypothetical protein  20.41 
 
 
386 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.12 
 
 
1203 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.37 
 
 
1760 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.94 
 
 
1088 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1433  hypothetical protein  29.58 
 
 
201 aa  56.2  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0074  hypothetical protein  30.4 
 
 
165 aa  55.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000360926  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.26 
 
 
1343 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.57 
 
 
1711 aa  55.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  25.56 
 
 
900 aa  55.1  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  26.99 
 
 
587 aa  54.7  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0647  hypothetical protein  34.38 
 
 
166 aa  52.4  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0138679  normal 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.84 
 
 
316 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  24.22 
 
 
903 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.57 
 
 
469 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.15 
 
 
278 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.7 
 
 
902 aa  49.3  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28 
 
 
1196 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  20 
 
 
442 aa  45.8  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.4 
 
 
428 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
457 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  24.59 
 
 
783 aa  44.3  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 
1106 aa  44.3  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  24.13 
 
 
898 aa  43.9  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.02 
 
 
830 aa  43.9  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>