18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0074 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0074  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000360926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.22 
 
 		 704 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3567  hypothetical protein  30.33 
 
 		 575 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.336155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1930  hypothetical protein  31.85 
 
 		 595 aa  53.9  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  0.0291599 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.58 
 
 		 704 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0647  hypothetical protein  30.94 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0138679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.03 
 
 		 708 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3564  hypothetical protein  33.01 
 
 		 572 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4789  hypothetical protein  35.05 
 
 		 587 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0838792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1433  hypothetical protein  28.18 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5660  hypothetical protein  26.97 
 
 		 588 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3939  hypothetical protein  37.65 
 
 		 649 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462657  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002229  hypothetical protein  33.03 
 
 		 187 aa  44.7  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.996514  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0874  ICE-like protease  36.9 
 
 		 360 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00749471  normal  0.127131 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00140  hypothetical protein  33.94 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.53 
 
 		 735 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0478  hypothetical protein  38.96 
 
 		 262 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.438425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2236  hypothetical protein  32.41 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>