50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5660 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5660  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1194    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3939  hypothetical protein  41.51 
 
 		 649 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462657  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1930  hypothetical protein  40.03 
 
 		 595 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  0.0291599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4789  hypothetical protein  34.98 
 
 		 587 aa  344  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0838792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2373  hypothetical protein  28.66 
 
 		 619 aa  210  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.651768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2831  hypothetical protein  26.36 
 
 		 605 aa  164  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 735 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3567  hypothetical protein  23.33 
 
 		 575 aa  125  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.336155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3564  hypothetical protein  24.33 
 
 		 572 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0874  ICE-like protease  27.08 
 
 		 360 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00749471  normal  0.127131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5664  hypothetical protein  28 
 
 		 382 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1935  hypothetical protein  25.84 
 
 		 386 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.11 
 
 		 708 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.98 
 
 		 704 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 875 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.03 
 
 		 704 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1154 aa  57.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  23.03 
 
 		 1116 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 1090 aa  54.7  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 1103 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1179 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 1188 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 1097 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 1144 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0169  hypothetical protein  31.46 
 
 		 298 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0226271  hitchhiker  0.00000000000758401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 1144 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 1138 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 1094 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3337  TonB-dependent receptor, plug  20.86 
 
 		 1119 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.661419  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1433  hypothetical protein  35.14 
 
 		 201 aa  47.8  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 894 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1119 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  22.46 
 
 		 1160 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1138 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1176 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1150 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  21.4 
 
 		 1148 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1152 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0074  hypothetical protein  26.97 
 
 		 165 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000360926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 1139 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 1189 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1108 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  20.83 
 
 		 1102 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1128 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  23.31 
 
 		 1132 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  22.11 
 
 		 1092 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  21.21 
 
 		 1077 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1106 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 1153 aa  43.9  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 873 aa  43.5  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>