76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3564 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3564  hypothetical protein  100 
 
 		 572 aa  1168    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3567  hypothetical protein  60.55 
 
 		 575 aa  724    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.336155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2373  hypothetical protein  27.23 
 
 		 619 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.651768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1930  hypothetical protein  27.46 
 
 		 595 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  0.0291599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2831  hypothetical protein  29.8 
 
 		 605 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4789  hypothetical protein  31.21 
 
 		 587 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0838792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5660  hypothetical protein  24.51 
 
 		 588 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3939  hypothetical protein  24.06 
 
 		 649 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462657  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.23 
 
 		 735 aa  110  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1935  hypothetical protein  30.49 
 
 		 386 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0874  ICE-like protease  29.43 
 
 		 360 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00749471  normal  0.127131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5664  hypothetical protein  29.89 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.02 
 
 		 708 aa  90.5  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.52 
 
 		 704 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.92 
 
 		 704 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1217 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 1144 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 1166 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 875 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  37.21 
 
 		 1237 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 1138 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1103 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1127 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1142 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1142 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 1128 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 1144 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1106 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1109 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1153 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1199 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1122 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1117 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 1176 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1165 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1102 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1179 aa  54.3  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1189 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1096 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 928 aa  52  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1202 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1163 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1109 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 1146 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1188 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 		 1150 aa  50.4  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  22.34 
 
 		 1155 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 1090 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 1198 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 		 1168 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1152 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 1189 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1102 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1128 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1169 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 1148 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1147 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1177 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 1139 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1120 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1138 aa  47.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1164 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1230 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1127 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1086 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1160 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0074  hypothetical protein  33.01 
 
 		 165 aa  46.6  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000360926  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1132 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1161 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1127 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 1190 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1154 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1198 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1177 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1094 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1124 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>