64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3567 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3564  hypothetical protein  60.55 
 
 		 572 aa  724    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3567  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1166    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.336155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2373  hypothetical protein  28.41 
 
 		 619 aa  193  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.651768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1930  hypothetical protein  27.41 
 
 		 595 aa  176  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  0.0291599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2831  hypothetical protein  28.28 
 
 		 605 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4789  hypothetical protein  25.62 
 
 		 587 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0838792  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3939  hypothetical protein  24.57 
 
 		 649 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462657  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5660  hypothetical protein  23.33 
 
 		 588 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.65 
 
 		 735 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1935  hypothetical protein  30.34 
 
 		 386 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5664  hypothetical protein  29.12 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0874  ICE-like protease  26.33 
 
 		 360 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00749471  normal  0.127131 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.82 
 
 		 704 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.85 
 
 		 708 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.06 
 
 		 704 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 1144 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 1142 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  30.16 
 
 		 1237 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1153 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 875 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  22.42 
 
 		 1103 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1138 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 1128 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1096 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 1189 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1217 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0074  hypothetical protein  30.33 
 
 		 165 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000360926  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  21.26 
 
 		 1142 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 1155 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 1106 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1146 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 1190 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1122 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1102 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 1166 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1179 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1161 aa  50.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0647  hypothetical protein  38.54 
 
 		 166 aa  50.4  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0138679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1144 aa  50.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 1188 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1164 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1176 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1177 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 1148 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0478  hypothetical protein  33.9 
 
 		 262 aa  48.5  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.438425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  21.88 
 
 		 1102 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1117 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 1198 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1129 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1139 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1077 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1202 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  23.7 
 
 		 1150 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1089 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00140  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1132 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1128 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 1090 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1127 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1089 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1165 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  23.65 
 
 		 1192 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1109 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1433  hypothetical protein  30.92 
 
 		 201 aa  43.5  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>