More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1608 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
1088 aa  2223    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.01 
 
 
1106 aa  241  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0890  WD-40 repeat-containing protein  29.81 
 
 
591 aa  211  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0212569  normal  0.465955 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.79 
 
 
941 aa  190  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.48 
 
 
902 aa  156  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  30.17 
 
 
1097 aa  145  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.22 
 
 
830 aa  117  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  29.68 
 
 
1619 aa  108  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.84 
 
 
1686 aa  98.2  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  33.21 
 
 
696 aa  94  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  30.83 
 
 
871 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  30.29 
 
 
1364 aa  93.2  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.85 
 
 
740 aa  89.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.1 
 
 
1523 aa  88.6  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.21 
 
 
947 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.27 
 
 
1652 aa  87.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.68 
 
 
1789 aa  87.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.63 
 
 
1510 aa  87  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  29.26 
 
 
1807 aa  86.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  30.35 
 
 
1188 aa  85.9  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.63 
 
 
1766 aa  84.7  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  34.68 
 
 
954 aa  83.2  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  25.35 
 
 
1160 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 
898 aa  84  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  27.69 
 
 
1599 aa  82.8  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.73 
 
 
1363 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  25.65 
 
 
1177 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.74 
 
 
1163 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  27.81 
 
 
1221 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.6 
 
 
1004 aa  80.1  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  30.22 
 
 
1656 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 
1481 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.78 
 
 
1348 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.91 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  34.26 
 
 
1041 aa  78.2  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 
900 aa  78.2  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  29.52 
 
 
1236 aa  77.8  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.41 
 
 
1553 aa  77.8  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 
890 aa  77.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.01 
 
 
344 aa  77.4  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  27.86 
 
 
1454 aa  77  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.02 
 
 
676 aa  77  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.08 
 
 
1711 aa  76.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  29.08 
 
 
1357 aa  75.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.94 
 
 
919 aa  76.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  29.36 
 
 
1242 aa  75.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  32.8 
 
 
872 aa  75.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  28.85 
 
 
1304 aa  75.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  23.13 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  29.41 
 
 
903 aa  75.1  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  28.72 
 
 
1214 aa  75.1  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  28.46 
 
 
1901 aa  75.1  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.41 
 
 
590 aa  75.1  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.58 
 
 
1760 aa  74.7  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  41.38 
 
 
1193 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  31.97 
 
 
335 aa  73.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  26.91 
 
 
577 aa  73.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  27.11 
 
 
331 aa  73.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  24.63 
 
 
1229 aa  73.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.66 
 
 
344 aa  73.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  30.24 
 
 
742 aa  72.8  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  24.6 
 
 
778 aa  73.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.64 
 
 
677 aa  72.8  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 
1474 aa  72.4  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  26.52 
 
 
1443 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  28.43 
 
 
565 aa  72.4  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30 
 
 
622 aa  72  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  29.67 
 
 
335 aa  72  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.3 
 
 
630 aa  72.4  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.14 
 
 
1868 aa  72.4  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 
1039 aa  72  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.7 
 
 
1831 aa  71.6  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  28.06 
 
 
1661 aa  71.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  33.62 
 
 
1188 aa  71.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  28.12 
 
 
1196 aa  71.2  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  27.13 
 
 
1878 aa  70.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  35.34 
 
 
346 aa  70.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  31.66 
 
 
780 aa  71.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  26.97 
 
 
1247 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  31.95 
 
 
790 aa  69.7  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.57 
 
 
1262 aa  69.7  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  27.2 
 
 
316 aa  69.7  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.59 
 
 
658 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  33.6 
 
 
1217 aa  69.3  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.38 
 
 
675 aa  68.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.69 
 
 
278 aa  68.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  25.17 
 
 
1209 aa  68.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  32.76 
 
 
774 aa  68.9  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.75 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  27.38 
 
 
914 aa  68.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 
1311 aa  68.6  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.67 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.43 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01387  meiotic recombination protein Ski8/Rec14, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08860)  31.31 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000649458  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.68 
 
 
1583 aa  68.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  26.34 
 
 
1714 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.98 
 
 
692 aa  67.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  37.93 
 
 
1858 aa  67.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  25.77 
 
 
1373 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  28.68 
 
 
437 aa  67.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>