More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3932 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 
914 aa  1880    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.96 
 
 
1652 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  40 
 
 
1364 aa  198  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  36.09 
 
 
1163 aa  194  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.14 
 
 
677 aa  191  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  37.32 
 
 
1363 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  32.86 
 
 
1523 aa  189  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  33.97 
 
 
1510 aa  187  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  39.42 
 
 
1221 aa  184  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  35.99 
 
 
947 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  35.17 
 
 
696 aa  184  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  41.04 
 
 
413 aa  179  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.07 
 
 
1481 aa  177  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  35.56 
 
 
1474 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.89 
 
 
630 aa  174  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  32.99 
 
 
317 aa  174  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  38.21 
 
 
414 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  33.67 
 
 
344 aa  173  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  35.84 
 
 
1553 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  36.52 
 
 
464 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  33 
 
 
344 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  38.05 
 
 
1656 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  34.45 
 
 
1236 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  40.29 
 
 
431 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  34.27 
 
 
335 aa  168  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  35.85 
 
 
742 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  33.63 
 
 
1789 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  33.66 
 
 
687 aa  165  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.74 
 
 
1686 aa  164  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3846  WD-40 repeat-containing protein  36.82 
 
 
277 aa  164  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  33.11 
 
 
316 aa  164  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  31.93 
 
 
589 aa  163  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  33.1 
 
 
1213 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  35.27 
 
 
675 aa  163  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.36 
 
 
1454 aa  162  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  35.92 
 
 
1443 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.01 
 
 
692 aa  161  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  33.91 
 
 
316 aa  161  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  31.42 
 
 
1196 aa  161  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  33.8 
 
 
342 aa  160  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  31.34 
 
 
657 aa  159  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  33.55 
 
 
434 aa  157  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  31.89 
 
 
1193 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.9 
 
 
676 aa  157  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.4 
 
 
664 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 
778 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  31.47 
 
 
316 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  32.17 
 
 
316 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  31.27 
 
 
1280 aa  155  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  41.55 
 
 
413 aa  154  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  31.82 
 
 
335 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  33.79 
 
 
1411 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  35.14 
 
 
1188 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  30.93 
 
 
578 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  31.08 
 
 
316 aa  152  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.34 
 
 
740 aa  151  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.65 
 
 
1357 aa  152  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  32.54 
 
 
1599 aa  151  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.84 
 
 
1557 aa  150  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.36 
 
 
733 aa  150  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.87 
 
 
919 aa  150  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  31.79 
 
 
1217 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  30 
 
 
1831 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.81 
 
 
1240 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.98 
 
 
682 aa  149  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.04 
 
 
1711 aa  149  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  33.66 
 
 
540 aa  148  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.42 
 
 
1188 aa  148  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  30.46 
 
 
1311 aa  146  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 
1878 aa  145  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  31.27 
 
 
1242 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  40.49 
 
 
552 aa  145  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  32.28 
 
 
774 aa  145  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  33.45 
 
 
565 aa  144  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  31.56 
 
 
1552 aa  144  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.05 
 
 
558 aa  144  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.56 
 
 
1039 aa  144  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  36.47 
 
 
346 aa  144  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.52 
 
 
1004 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.57 
 
 
576 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  31.72 
 
 
1247 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 
642 aa  141  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  34.59 
 
 
1041 aa  141  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  31.62 
 
 
577 aa  140  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  31.01 
 
 
1208 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  29.75 
 
 
1229 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.14 
 
 
930 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  28.92 
 
 
1807 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  42.47 
 
 
521 aa  139  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.23 
 
 
1760 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.09 
 
 
1262 aa  139  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.12 
 
 
1868 aa  138  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  35.08 
 
 
669 aa  138  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.79 
 
 
1190 aa  137  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  41.44 
 
 
546 aa  137  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  31.46 
 
 
608 aa  137  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  32.08 
 
 
1176 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  34.15 
 
 
1714 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 
1858 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  36.41 
 
 
790 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>