64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1153 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
278 aa  565  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.14 
 
 
1004 aa  98.6  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.45 
 
 
1004 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.58 
 
 
579 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.53 
 
 
578 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.13 
 
 
578 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.59 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.8 
 
 
464 aa  72.4  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  25.2 
 
 
442 aa  72.4  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  28.26 
 
 
1097 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.69 
 
 
1088 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.22 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.52 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.91 
 
 
830 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  26.91 
 
 
1619 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 
890 aa  62  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.49 
 
 
658 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.21 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.44 
 
 
1686 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 
898 aa  59.3  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.35 
 
 
1760 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.44 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 
871 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6789  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.46 
 
 
1554 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.03 
 
 
324 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.03 
 
 
795 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.03 
 
 
795 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.86 
 
 
590 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.09 
 
 
1343 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0189  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.53 
 
 
313 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.49 
 
 
1711 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.05 
 
 
941 aa  49.7  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3116  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.04 
 
 
557 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.15 
 
 
704 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  25 
 
 
587 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.15 
 
 
704 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.77 
 
 
729 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.41 
 
 
457 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  26.87 
 
 
438 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
708 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2362  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.85 
 
 
630 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.26 
 
 
805 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.1 
 
 
469 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  24.22 
 
 
900 aa  47  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.64 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.69 
 
 
1196 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3611  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.79 
 
 
649 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.27 
 
 
275 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
285 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.35 
 
 
1316 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  24.22 
 
 
903 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
633 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  26.85 
 
 
403 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.8 
 
 
841 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0296  hypothetical protein  29.7 
 
 
671 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  22.91 
 
 
1160 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
355 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.59 
 
 
789 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.57 
 
 
843 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.12 
 
 
445 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.62 
 
 
902 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1221  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.13 
 
 
440 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.7 
 
 
324 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.73 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>