99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2534 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
941 aa  1934    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  60.36 
 
 
902 aa  536  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.79 
 
 
1088 aa  190  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  26.26 
 
 
1097 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.1 
 
 
830 aa  149  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  25.49 
 
 
1619 aa  118  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1425  hypothetical protein  34.09 
 
 
598 aa  90.5  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000495219  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.87 
 
 
1106 aa  81.6  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  23.73 
 
 
1160 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.82 
 
 
1343 aa  78.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 
898 aa  77.4  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 
871 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.69 
 
 
457 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.34 
 
 
578 aa  71.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.61 
 
 
309 aa  70.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.33 
 
 
578 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  30.74 
 
 
900 aa  70.1  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 
890 aa  69.7  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.39 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.93 
 
 
1162 aa  68.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.8 
 
 
579 aa  68.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  29.13 
 
 
903 aa  67.4  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1424  hypothetical protein  20.93 
 
 
385 aa  65.9  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000562117  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.12 
 
 
469 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  30.49 
 
 
587 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.94 
 
 
1274 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.46 
 
 
324 aa  61.6  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  23.41 
 
 
442 aa  61.6  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.19 
 
 
316 aa  61.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.42 
 
 
1363 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.29 
 
 
1686 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.57 
 
 
1454 aa  59.3  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.26 
 
 
658 aa  58.5  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.53 
 
 
324 aa  58.5  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.83 
 
 
696 aa  58.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6789  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.62 
 
 
1554 aa  57.4  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.97 
 
 
1196 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 
344 aa  57.4  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.88 
 
 
676 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  23.4 
 
 
925 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  20.9 
 
 
1236 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.51 
 
 
442 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.25 
 
 
489 aa  55.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.43 
 
 
261 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.51 
 
 
1163 aa  54.7  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.45 
 
 
445 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  23.65 
 
 
1217 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.4 
 
 
428 aa  53.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.45 
 
 
445 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  23.66 
 
 
443 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.24 
 
 
316 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.19 
 
 
355 aa  52.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.02 
 
 
1553 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
729 aa  52  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 
397 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.52 
 
 
1711 aa  51.2  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  22.79 
 
 
344 aa  50.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  20.51 
 
 
1193 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.62 
 
 
486 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.05 
 
 
278 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  28.1 
 
 
331 aa  50.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24 
 
 
1760 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.76 
 
 
1807 aa  50.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  30.83 
 
 
774 aa  50.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.36 
 
 
795 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  22.9 
 
 
1523 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.36 
 
 
795 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.59 
 
 
735 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  21.23 
 
 
947 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  27.53 
 
 
770 aa  48.9  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.72 
 
 
324 aa  48.1  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  23.62 
 
 
742 aa  48.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.51 
 
 
798 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.69 
 
 
1039 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  20.89 
 
 
1041 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  23.45 
 
 
464 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  23.25 
 
 
1364 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.34 
 
 
757 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.62 
 
 
481 aa  46.6  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.18 
 
 
1481 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  24.18 
 
 
1491 aa  47  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.17 
 
 
675 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.34 
 
 
608 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.16 
 
 
692 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  28.71 
 
 
608 aa  45.8  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  25 
 
 
576 aa  45.8  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  23.84 
 
 
778 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.31 
 
 
657 aa  45.4  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  26.06 
 
 
504 aa  45.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.42 
 
 
677 aa  45.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1503  diguanylate phosphodiesterase  23.89 
 
 
731 aa  45.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.293201  hitchhiker  0.000197979 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  22.26 
 
 
335 aa  45.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  23.31 
 
 
1357 aa  45.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0384  WD-40 repeat-containing protein  21.4 
 
 
423 aa  45.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.18 
 
 
924 aa  44.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3116  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.71 
 
 
557 aa  44.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5293  cytochrome c class I  30 
 
 
426 aa  44.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.88 
 
 
1262 aa  44.3  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  30.86 
 
 
1242 aa  44.3  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>