More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2900 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
464 aa  947    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.92 
 
 
428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  44.64 
 
 
442 aa  323  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0721  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.71 
 
 
696 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3027  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.59 
 
 
697 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438464  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.8 
 
 
658 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 
898 aa  94.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 
871 aa  94  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 
890 aa  90.5  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 
900 aa  87.4  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  25.49 
 
 
903 aa  83.6  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.1 
 
 
1343 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.07 
 
 
1686 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  37.69 
 
 
1585 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3217  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.69 
 
 
531 aa  76.6  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.86766  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2362  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
630 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  38.85 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  32.16 
 
 
821 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  37.4 
 
 
1156 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  38.17 
 
 
762 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  37.88 
 
 
1021 aa  73.6  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0197  ankyrin repeat-containing protein  38.76 
 
 
165 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.8 
 
 
278 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.94 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  40.31 
 
 
870 aa  70.1  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  37.23 
 
 
756 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.03 
 
 
795 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.03 
 
 
795 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  36.71 
 
 
590 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.7 
 
 
830 aa  68.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.88 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  33.77 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  33.99 
 
 
1622 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08300  conserved hypothetical protein  40 
 
 
1977 aa  67.4  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000214418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.61 
 
 
501 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  35.88 
 
 
479 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  37.8 
 
 
1402 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  36.84 
 
 
494 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  36.92 
 
 
2413 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.7 
 
 
1004 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  35.11 
 
 
344 aa  66.6  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.15 
 
 
1760 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.94 
 
 
1004 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  33.56 
 
 
196 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  34.75 
 
 
1133 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  37.88 
 
 
1030 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  39.23 
 
 
490 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  35.11 
 
 
855 aa  64.7  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 
469 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3209  putative transcriptional regulator  26.69 
 
 
1687 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000587168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.14 
 
 
309 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  35.88 
 
 
329 aa  62.4  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03267  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 
766 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.104781  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.09 
 
 
1711 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3611  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.96 
 
 
649 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.5 
 
 
729 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.43 
 
 
497 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  38.1 
 
 
181 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0189  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.23 
 
 
313 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.7 
 
 
477 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0035  ankyrin repeat-containing protein  30.08 
 
 
288 aa  60.8  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3255  ankyrin  35.11 
 
 
395 aa  60.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.85 
 
 
798 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  27.16 
 
 
954 aa  60.5  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.5 
 
 
590 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1578  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 
719 aa  60.5  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2666  ankyrin  36.97 
 
 
237 aa  60.5  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.931958  hitchhiker  0.000000569803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  33.59 
 
 
157 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.23 
 
 
324 aa  60.1  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  24.51 
 
 
509 aa  60.1  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  25.91 
 
 
544 aa  60.1  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  32.97 
 
 
423 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  37.7 
 
 
287 aa  60.1  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  37.01 
 
 
1061 aa  60.1  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.64 
 
 
841 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.35 
 
 
491 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
615 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  25.29 
 
 
509 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  34.85 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  32.82 
 
 
750 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  29.85 
 
 
731 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  25.74 
 
 
781 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  32.82 
 
 
1005 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  30.53 
 
 
404 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  27.57 
 
 
225 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.8 
 
 
316 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0173  Ankyrin  38.95 
 
 
149 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.947078  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  33.07 
 
 
144 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  38.26 
 
 
426 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
1316 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  37.7 
 
 
135 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  38.95 
 
 
149 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  33.33 
 
 
723 aa  57  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2373  Ankyrin  36.46 
 
 
555 aa  57  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000336897  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0830  hypothetical protein  34.62 
 
 
307 aa  57  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0248874 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.1 
 
 
843 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0498  ankyrin repeat-containing protein  34.34 
 
 
335 aa  57  0.0000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  29.8 
 
 
891 aa  57  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37212  predicted protein  37.27 
 
 
146 aa  56.6  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.12 
 
 
499 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>