More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2854 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  100 
 
 
225 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  57.21 
 
 
223 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  60.71 
 
 
223 aa  254  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2259  ankyrin  52.04 
 
 
218 aa  235  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  54.09 
 
 
222 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1983  Ankyrin  49.04 
 
 
228 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1721  ankyrin  49.04 
 
 
228 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  48.56 
 
 
247 aa  197  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3408  ankyrin  48.08 
 
 
231 aa  188  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.90032  normal  0.939091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2259  ankyrin repeat-containing signal peptide protein  47.87 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980373  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1943  Ankyrin  47.34 
 
 
241 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.579391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1438  ankyrin  48.02 
 
 
248 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  47.87 
 
 
257 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1824  ankyrin  46.91 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109877  hitchhiker  0.0044061 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1856  hypothetical protein  43.52 
 
 
208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  44.92 
 
 
235 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0963  ankyrin  39.8 
 
 
236 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  43.59 
 
 
236 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  43.59 
 
 
236 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  43.59 
 
 
236 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  44.39 
 
 
242 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  44.39 
 
 
240 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  44.39 
 
 
242 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  43.08 
 
 
236 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  43.08 
 
 
236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  42.56 
 
 
236 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  44.02 
 
 
235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  44.02 
 
 
235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  44.02 
 
 
235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  44.02 
 
 
235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  44.02 
 
 
240 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1788  aankyrin repeat-containing protein  41.75 
 
 
291 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1421  Ankyrin  41.15 
 
 
284 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1462  Ankyrin  43.58 
 
 
284 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.640489  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  38.25 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  38.76 
 
 
219 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2499  Ankyrin  37.5 
 
 
243 aa  101  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0280385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  32.35 
 
 
344 aa  99  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  34.73 
 
 
382 aa  96.7  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  36.31 
 
 
1585 aa  95.1  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  34.39 
 
 
762 aa  95.1  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  35.75 
 
 
321 aa  95.1  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
329 aa  94.4  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  35.29 
 
 
305 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  32.43 
 
 
469 aa  92.8  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  35.36 
 
 
490 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3277  ankyrin  41.67 
 
 
140 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  38.92 
 
 
870 aa  90.5  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 
1030 aa  90.5  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  31.84 
 
 
395 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  44.36 
 
 
140 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  33.65 
 
 
404 aa  89.4  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  34.15 
 
 
347 aa  87.8  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  33.14 
 
 
954 aa  87.4  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  34.88 
 
 
274 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  32.29 
 
 
426 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  32.24 
 
 
865 aa  87.4  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  36.48 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  37.2 
 
 
287 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  34.15 
 
 
544 aa  85.9  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  32.24 
 
 
931 aa  85.5  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.88 
 
 
1402 aa  85.1  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6564  Ankyrin  36.88 
 
 
166 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3561  Ankyrin  36.46 
 
 
331 aa  85.1  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  35.33 
 
 
220 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  32.8 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  32.78 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  35.15 
 
 
541 aa  82.4  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  34.46 
 
 
483 aa  82  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0475  ankyrin repeat-containing protein  27.94 
 
 
456 aa  82  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10819  conserved hypothetical protein  30.05 
 
 
752 aa  81.6  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  36.24 
 
 
161 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.49 
 
 
2413 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  33.33 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  35.76 
 
 
494 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  33.55 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  40.68 
 
 
584 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  35.48 
 
 
2171 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  32.4 
 
 
1156 aa  79  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0324  ankyrin repeat-containing protein  37.6 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  31.49 
 
 
293 aa  79  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  31.85 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  29.89 
 
 
711 aa  78.2  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  31.19 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  32.3 
 
 
640 aa  78.2  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  29.61 
 
 
646 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  39.17 
 
 
175 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0162  ankyrin  40.88 
 
 
141 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  31.58 
 
 
4520 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 
1198 aa  77  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30.41 
 
 
731 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0270  ankyrin  32.72 
 
 
445 aa  77  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  30.51 
 
 
545 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  23.95 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  34.19 
 
 
855 aa  76.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  31.64 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0454  Ankyrin  26.27 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0198702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  38.93 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  31.37 
 
 
723 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  36.31 
 
 
756 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>