More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1824 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1824  ankyrin  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109877  hitchhiker  0.0044061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1438  ankyrin  80 
 
 		 248 aa  341  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1421  Ankyrin  66.18 
 
 		 284 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1462  Ankyrin  65.17 
 
 		 284 aa  265  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.640489  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1788  aankyrin repeat-containing protein  60.54 
 
 		 291 aa  262  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  56.46 
 
 		 257 aa  241  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1943  Ankyrin  58.55 
 
 		 241 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.579391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2259  ankyrin repeat-containing signal peptide protein  57.51 
 
 		 250 aa  232  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980373  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  53.55 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  52.83 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  52.83 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  52.83 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  56.78 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  56.78 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  56.78 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  56.78 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  56.78 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  56.78 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  56.78 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  56.78 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  51.42 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  51.42 
 
 		 236 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  50.94 
 
 		 236 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0963  ankyrin  44.04 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  46.88 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  45.37 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  45.79 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1721  ankyrin  46.35 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1983  Ankyrin  46.35 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  43.39 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2259  ankyrin  44.02 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  45.71 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  41.08 
 
 		 216 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3408  ankyrin  42.44 
 
 		 231 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.90032  normal  0.939091 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1856  hypothetical protein  37.79 
 
 		 208 aa  118  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2499  Ankyrin  37.5 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0280385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  36.87 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1585 aa  104  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  32 
 
 		 344 aa  99  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  36.23 
 
 		 469 aa  92.4  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  33.73 
 
 		 321 aa  88.2  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  36.57 
 
 		 2413 aa  88.2  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  28.91 
 
 		 870 aa  84  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  28.65 
 
 		 954 aa  84  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  33.15 
 
 		 382 aa  82  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  33.54 
 
 		 762 aa  82  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  30.94 
 
 		 855 aa  81.6  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  32.35 
 
 		 1156 aa  80.9  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1402 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  30.05 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  30.1 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  34.23 
 
 		 490 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  31.35 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  30.48 
 
 		 305 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0477  ankyrin repeat-containing protein  29.15 
 
 		 290 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  31.35 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  31.35 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1784  hypothetical protein  33.13 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2205  Ankyrin  31.05 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00267936  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  33.73 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  36 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0564  ankyrin repeat-containing protein  30.81 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0626  ankyrin repeat-containing protein  30.27 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0533  ankyrin repeat-containing protein  30.81 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  35.25 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2031  ankyrin  35.37 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000130929  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  30.68 
 
 		 2171 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  34.85 
 
 		 329 aa  75.5  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  32.28 
 
 		 723 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  34.01 
 
 		 544 aa  75.1  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  43.52 
 
 		 140 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  29.89 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  43.96 
 
 		 1030 aa  74.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  32.75 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  32.33 
 
 		 138 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  30.56 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  29.35 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  29.52 
 
 		 891 aa  73.2  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  30.46 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  39.09 
 
 		 821 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  29.1 
 
 		 4520 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  29.52 
 
 		 483 aa  72  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  32.98 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  33.13 
 
 		 865 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  32.98 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0270  ankyrin  28.98 
 
 		 445 aa  72  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  35.33 
 
 		 545 aa  72  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  33.12 
 
 		 590 aa  71.6  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  32.98 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0574  hypothetical protein  31.21 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0996  hypothetical protein  27.4 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0836466 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  28.57 
 
 		 750 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  38.76 
 
 		 711 aa  71.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  37.93 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6564  Ankyrin  32.59 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  32.97 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  32.76 
 
 		 931 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  32.45 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1005 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>