More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1788 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1788  aankyrin repeat-containing protein  100 
 
 		 291 aa  585  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1421  Ankyrin  81.64 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1462  Ankyrin  78.38 
 
 		 284 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.640489  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1824  ankyrin  64.02 
 
 		 226 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109877  hitchhiker  0.0044061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1438  ankyrin  55.56 
 
 		 248 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  46.58 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1943  Ankyrin  49.25 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.579391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2259  ankyrin repeat-containing signal peptide protein  48.47 
 
 		 250 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980373  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  48.9 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  46.41 
 
 		 240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  46.41 
 
 		 242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  46.41 
 
 		 242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  47.06 
 
 		 235 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  47.06 
 
 		 235 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  47.06 
 
 		 235 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  47.06 
 
 		 235 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  43.04 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  43.04 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  43.04 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  47.55 
 
 		 240 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  46.5 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  46.5 
 
 		 236 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0963  ankyrin  36.97 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  42.71 
 
 		 236 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  41.95 
 
 		 223 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  41.67 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1721  ankyrin  45.83 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1983  Ankyrin  45.41 
 
 		 228 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  44.32 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2259  ankyrin  39.9 
 
 		 218 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  40.22 
 
 		 216 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  38.66 
 
 		 247 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  39.07 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3408  ankyrin  40.85 
 
 		 231 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.90032  normal  0.939091 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1856  hypothetical protein  36.9 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  33.51 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  35.98 
 
 		 1585 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  35.82 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  33.68 
 
 		 870 aa  92.4  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  35.39 
 
 		 1156 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  33.7 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  28.65 
 
 		 954 aa  83.6  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  30.84 
 
 		 1061 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.31 
 
 		 2413 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  36.08 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2499  Ankyrin  32.18 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0280385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  32.78 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  36.36 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  30.51 
 
 		 1030 aa  77  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  30.65 
 
 		 762 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  34.59 
 
 		 382 aa  75.5  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  33.89 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  35.43 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3421  Ankyrin  32.75 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  35.25 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6564  Ankyrin  35.11 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2481  Ankyrin  30.17 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000229526  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  30.25 
 
 		 646 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  32.41 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  39.29 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 		 1622 aa  68.9  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  40 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  29.82 
 
 		 723 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  32.92 
 
 		 1021 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  31.9 
 
 		 790 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  31.38 
 
 		 640 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  30.66 
 
 		 138 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  37.34 
 
 		 1402 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  29.09 
 
 		 891 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  34.3 
 
 		 222 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  32.68 
 
 		 855 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  30 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  31.82 
 
 		 490 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  30.59 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  32.43 
 
 		 541 aa  65.5  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1784  hypothetical protein  31.74 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  30.43 
 
 		 590 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  32.1 
 
 		 2171 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  43.48 
 
 		 140 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  29.81 
 
 		 4520 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  31.14 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  33.13 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  29.3 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  32.73 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1581  hypothetical protein  31.88 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  28.57 
 
 		 821 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  29.17 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  36.03 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  28.37 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  33.93 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  34.75 
 
 		 750 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  31.89 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  36.92 
 
 		 583 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1063  Ankyrin  39.74 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  30.21 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  30.86 
 
 		 545 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03267  conserved hypothetical protein  25.99 
 
 		 766 aa  62.8  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42811  predicted protein  37.97 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  30.21 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0493  ankyrin  31.33 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>