More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1952 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  100 
 
 
223 aa  449  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  77.31 
 
 
223 aa  325  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2259  ankyrin  56.28 
 
 
218 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  60.1 
 
 
225 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1983  Ankyrin  55.07 
 
 
228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1721  ankyrin  54.37 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  58.13 
 
 
222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3408  ankyrin  53.2 
 
 
231 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.90032  normal  0.939091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  48.54 
 
 
247 aa  191  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  45.62 
 
 
257 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1943  Ankyrin  45.92 
 
 
241 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.579391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2259  ankyrin repeat-containing signal peptide protein  46.35 
 
 
250 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980373  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  48.51 
 
 
235 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1438  ankyrin  45.24 
 
 
248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1824  ankyrin  47.89 
 
 
226 aa  171  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109877  hitchhiker  0.0044061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  48.77 
 
 
236 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  48.77 
 
 
236 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  48.77 
 
 
236 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  48.77 
 
 
236 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1856  hypothetical protein  46.11 
 
 
208 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  47.29 
 
 
236 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  47.29 
 
 
236 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  48.21 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  48.21 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  48.21 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  48.17 
 
 
240 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  47.64 
 
 
235 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  47.64 
 
 
235 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  47.64 
 
 
235 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  47.64 
 
 
235 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1462  Ankyrin  42.31 
 
 
284 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.640489  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1421  Ankyrin  42.16 
 
 
284 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1788  aankyrin repeat-containing protein  41.95 
 
 
291 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  42.02 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0963  ankyrin  37.5 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  39.47 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2499  Ankyrin  39.07 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0280385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  33.84 
 
 
344 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  39.55 
 
 
140 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  37.35 
 
 
469 aa  99  5e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3277  ankyrin  39.1 
 
 
140 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  35.59 
 
 
1585 aa  95.1  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  49.53 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  36 
 
 
541 aa  94  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  49.53 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  33.72 
 
 
954 aa  93.2  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  39.34 
 
 
870 aa  92.4  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  33.33 
 
 
762 aa  92  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  33.33 
 
 
296 aa  91.7  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  37.35 
 
 
321 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  36.42 
 
 
646 aa  89.4  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6564  Ankyrin  36.88 
 
 
166 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  31.12 
 
 
382 aa  87.8  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  34.07 
 
 
4520 aa  88.2  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  33.82 
 
 
305 aa  87.8  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  34.71 
 
 
490 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30.37 
 
 
2413 aa  86.3  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0173  Ankyrin  33.81 
 
 
149 aa  85.5  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.947078  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  35.4 
 
 
865 aa  85.5  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  33.81 
 
 
149 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  36.84 
 
 
138 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  37.3 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  30.4 
 
 
494 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  30.52 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0162  ankyrin  41.04 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0270  ankyrin  33.94 
 
 
445 aa  82.4  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  40.87 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  38.57 
 
 
217 aa  82  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  34.97 
 
 
474 aa  82  0.000000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  38.84 
 
 
178 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  39.17 
 
 
175 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  32.58 
 
 
287 aa  82  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_002978  WD0498  ankyrin repeat-containing protein  32.02 
 
 
335 aa  81.6  0.000000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  27.93 
 
 
253 aa  81.6  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4159  ankyrin repeat-containing protein  44.04 
 
 
145 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  40.71 
 
 
173 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  34.84 
 
 
1156 aa  80.5  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  39.67 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.39 
 
 
1402 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0454  Ankyrin  27.45 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0198702  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  30.08 
 
 
931 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2205  Ankyrin  31.89 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00267936  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  33.54 
 
 
1030 aa  79.3  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  37.5 
 
 
174 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  30.65 
 
 
483 aa  79  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  40.17 
 
 
750 aa  78.6  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3435  ankyrin repeat-containing protein  41.04 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  31.29 
 
 
347 aa  78.2  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0035  ankyrin repeat-containing protein  36.81 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  39.06 
 
 
821 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  40.87 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  33.14 
 
 
545 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  32.37 
 
 
891 aa  77.4  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  34.36 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  30.43 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  36.72 
 
 
483 aa  76.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  39.67 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  30.07 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  38.69 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  35.82 
 
 
423 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>