More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1412 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  100 
 
 
174 aa  338  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  91.95 
 
 
174 aa  313  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  91.95 
 
 
174 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  87.36 
 
 
174 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  66.67 
 
 
181 aa  221  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  70.44 
 
 
181 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  64.24 
 
 
172 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  58.14 
 
 
178 aa  184  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  60.25 
 
 
178 aa  183  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  58.49 
 
 
200 aa  177  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  58.49 
 
 
194 aa  177  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  58.49 
 
 
195 aa  175  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  59.18 
 
 
175 aa  174  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  58.43 
 
 
174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  54.24 
 
 
192 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  52.6 
 
 
173 aa  168  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  60.93 
 
 
171 aa  168  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  59.6 
 
 
171 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  57.93 
 
 
176 aa  161  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  56.64 
 
 
187 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  56.64 
 
 
187 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  57.43 
 
 
170 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  43.31 
 
 
172 aa  114  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  48.57 
 
 
190 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  48.44 
 
 
125 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  42.22 
 
 
201 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  42.98 
 
 
162 aa  101  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  36.23 
 
 
156 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  48 
 
 
145 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  36.23 
 
 
156 aa  99.4  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  46.21 
 
 
139 aa  99  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  36.23 
 
 
156 aa  98.2  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  38.62 
 
 
161 aa  97.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  41.09 
 
 
187 aa  97.4  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  43.2 
 
 
130 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  46.72 
 
 
135 aa  95.5  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  37.84 
 
 
197 aa  94.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  35.86 
 
 
197 aa  91.7  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  36.18 
 
 
157 aa  90.9  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  38.19 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  41.86 
 
 
203 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  40 
 
 
216 aa  89  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  45.61 
 
 
128 aa  89  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  37.41 
 
 
173 aa  88.6  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  35.66 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  34.88 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  39.53 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  44.44 
 
 
128 aa  85.5  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  44.17 
 
 
122 aa  85.5  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  37.16 
 
 
203 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  37.16 
 
 
203 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  37.16 
 
 
203 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  43.38 
 
 
149 aa  84.7  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  53.85 
 
 
140 aa  84.3  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  40.31 
 
 
219 aa  84  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  37.68 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  34.78 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  34.93 
 
 
217 aa  82  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  44.79 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  35.82 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  38.26 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  36.8 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  32.45 
 
 
855 aa  79.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  34.29 
 
 
404 aa  78.2  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  38.52 
 
 
426 aa  77.8  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  40.35 
 
 
223 aa  77.8  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  39.67 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  37.98 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  34.62 
 
 
2171 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  43.24 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  38.19 
 
 
321 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  42.59 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  32.62 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  38.66 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  39.84 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  30.13 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  30.13 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  44.44 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  36.61 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  35.11 
 
 
870 aa  72  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  29.8 
 
 
382 aa  71.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  38.35 
 
 
490 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  32.3 
 
 
222 aa  70.9  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  35.37 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1856  hypothetical protein  38.35 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  39.13 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  38.18 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  34.33 
 
 
1030 aa  69.3  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  37.3 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.87 
 
 
1402 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  37.3 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  38.26 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3533  Ankyrin  37.41 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.254367  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  38.26 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  38.26 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  36.23 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  31.69 
 
 
1061 aa  68.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  38.26 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  32.85 
 
 
762 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  34.21 
 
 
293 aa  67.4  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>