More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1729 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  100 
 
 		 172 aa  348  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  73.05 
 
 		 181 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  73.49 
 
 		 181 aa  241  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  62.64 
 
 		 174 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  64.24 
 
 		 174 aa  210  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  64.85 
 
 		 174 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  64.24 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  59.76 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  59.17 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  55.62 
 
 		 171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  55.03 
 
 		 171 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  56.89 
 
 		 175 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  54.49 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  54 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  53.09 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  53.09 
 
 		 200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  52.47 
 
 		 195 aa  160  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  53.57 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  59.09 
 
 		 170 aa  154  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  52.94 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  50.67 
 
 		 187 aa  148  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  50.67 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  42.54 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  49.25 
 
 		 135 aa  110  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  41.77 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  47.93 
 
 		 125 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  37.01 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  45.83 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  52.63 
 
 		 137 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  33.92 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  43.08 
 
 		 128 aa  99.8  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  42.5 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  37.78 
 
 		 201 aa  97.4  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  37.86 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  37.93 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  37.41 
 
 		 185 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  36.96 
 
 		 189 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  40.62 
 
 		 130 aa  94.4  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  41.13 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  52.75 
 
 		 122 aa  92.4  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  36.76 
 
 		 156 aa  91.3  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  36.96 
 
 		 183 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  36.76 
 
 		 156 aa  90.9  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  36.76 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  40.14 
 
 		 219 aa  88.6  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  39.06 
 
 		 203 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  36.55 
 
 		 217 aa  86.3  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  37.98 
 
 		 187 aa  85.5  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  32.43 
 
 		 197 aa  85.1  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  40 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1402 aa  84  9e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  35.04 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  38.52 
 
 		 1585 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  39.5 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  40.87 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  34.72 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  46.36 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 		 1133 aa  80.9  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  44.63 
 
 		 235 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  44.63 
 
 		 235 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  44.63 
 
 		 235 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  44.63 
 
 		 235 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  44.63 
 
 		 242 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  44.63 
 
 		 240 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  44.63 
 
 		 242 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  40.6 
 
 		 490 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  37.84 
 
 		 584 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  49.41 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  36.92 
 
 		 472 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  43.8 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  34.76 
 
 		 2171 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  46.43 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  39.68 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  37.41 
 
 		 583 aa  79  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  33.12 
 
 		 404 aa  78.6  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  38.53 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  42.98 
 
 		 235 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  32.89 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  42.98 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  42.98 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  38.93 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  42.98 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  37.98 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  35.2 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  34.53 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  42.15 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  42.15 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  39.39 
 
 		 494 aa  76.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  42.15 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  34.03 
 
 		 954 aa  75.5  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  39.13 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  34.13 
 
 		 344 aa  75.5  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  33.11 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  33.11 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  32.14 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  33.11 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  39.64 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  39.83 
 
 		 346 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  41.23 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02885  ankyrin-like protein  35.71 
 
 		 1097 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>