280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2707 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  100 
 
 
128 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  68.6 
 
 
128 aa  163  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  55.66 
 
 
125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  52.78 
 
 
130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  52.34 
 
 
139 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  46.9 
 
 
135 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  58.1 
 
 
140 aa  103  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  46.85 
 
 
178 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  47.75 
 
 
175 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  43.18 
 
 
170 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  45.05 
 
 
181 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  49.06 
 
 
137 aa  99.4  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  45.95 
 
 
181 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  57.41 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  45.05 
 
 
178 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  50 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  45.45 
 
 
200 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  50.91 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  44.88 
 
 
174 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  47.22 
 
 
194 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  40.3 
 
 
172 aa  92.8  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  44 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  46.3 
 
 
195 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  42.06 
 
 
171 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  50 
 
 
187 aa  90.1  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  50 
 
 
187 aa  90.1  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  45.37 
 
 
192 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  45.37 
 
 
174 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  37.98 
 
 
156 aa  86.7  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  37.98 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  45.37 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  37.98 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  44.44 
 
 
174 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  39.52 
 
 
138 aa  84.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  44.44 
 
 
174 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  49.17 
 
 
145 aa  84  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  44.44 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  37.1 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  37.19 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  43.75 
 
 
189 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  46.61 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  41.44 
 
 
197 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  41.73 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  43.48 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  45.63 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  35.2 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  41.05 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  41.05 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3252  AnkB protein  42.86 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103832  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  34.38 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  44.05 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  44.05 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  35.9 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  36.52 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  40.18 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  41.96 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  40.17 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  34.21 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  40.74 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  36.7 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  33.33 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  43.02 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  40.18 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  37.63 
 
 
1030 aa  64.7  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  33.94 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  37.5 
 
 
203 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  37.5 
 
 
203 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  37.5 
 
 
203 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  37.5 
 
 
203 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1187  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
188 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  35.19 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  31.58 
 
 
197 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  39.47 
 
 
1156 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  37.21 
 
 
870 aa  57.8  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  35.58 
 
 
395 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0428  Ankyrin  33.33 
 
 
222 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43531  predicted protein  30.1 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181933  normal  0.18997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  32.48 
 
 
163 aa  55.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  40.22 
 
 
1099 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2693  ankyrin repeat-containing protein  34.44 
 
 
933 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.82952  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  40.22 
 
 
1101 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  31.25 
 
 
382 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  36.78 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  36.78 
 
 
217 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  35.16 
 
 
756 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  35.56 
 
 
173 aa  53.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  32.71 
 
 
931 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  34.12 
 
 
196 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  38.1 
 
 
1005 aa  52.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  31.03 
 
 
347 aa  52.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  32.69 
 
 
226 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  36.11 
 
 
216 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  33.71 
 
 
293 aa  52.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  35.19 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  40.58 
 
 
4520 aa  52.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0173  Ankyrin  35.63 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.947078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  35.48 
 
 
287 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2499  Ankyrin  38.32 
 
 
243 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0280385  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  29.59 
 
 
217 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2884  ankyrin  33.72 
 
 
163 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00861842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>