230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2134 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  100 
 
 
136 aa  263  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  66.37 
 
 
130 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  56.49 
 
 
135 aa  144  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  62.1 
 
 
125 aa  139  9e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  57.81 
 
 
132 aa  136  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  55.64 
 
 
138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  55.56 
 
 
137 aa  134  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  54.03 
 
 
139 aa  116  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  57.14 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  51.59 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  57.98 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  50 
 
 
175 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  50 
 
 
178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  54.05 
 
 
122 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  49.21 
 
 
187 aa  103  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  57 
 
 
145 aa  103  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  49.21 
 
 
187 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  50 
 
 
174 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  48.31 
 
 
128 aa  100  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  50 
 
 
200 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  53.97 
 
 
176 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  49.21 
 
 
194 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  48.41 
 
 
195 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  50.91 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  49.21 
 
 
192 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  43.22 
 
 
173 aa  93.6  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  48.65 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  44.44 
 
 
171 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  42.86 
 
 
172 aa  89.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  46.43 
 
 
181 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  47.66 
 
 
170 aa  86.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  44.64 
 
 
181 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  49.07 
 
 
171 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  43.75 
 
 
174 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  45.05 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  45.05 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  40.82 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  40.82 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  39.68 
 
 
172 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  40.82 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  38.83 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  36.36 
 
 
197 aa  77  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  41.67 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  43.24 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  41.07 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  42.99 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  37.84 
 
 
184 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  41.38 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  40.18 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  44.44 
 
 
190 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  37.84 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  37.17 
 
 
197 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  35.45 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  44.58 
 
 
490 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  38.79 
 
 
203 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  33.33 
 
 
192 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  41.53 
 
 
395 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  34.38 
 
 
185 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  34.38 
 
 
185 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  39.77 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3252  AnkB protein  31.13 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103832  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1187  ankyrin repeat-containing protein  34.55 
 
 
188 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  40.24 
 
 
203 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  30.48 
 
 
187 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  35.96 
 
 
203 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  39.08 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  35.96 
 
 
203 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  35.96 
 
 
203 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  42.27 
 
 
208 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0645  Ankyrin  38.95 
 
 
240 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  41.57 
 
 
1099 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  33.33 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  33.33 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  41.57 
 
 
1101 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  40.45 
 
 
194 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  39.58 
 
 
222 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9151  predicted protein  41.67 
 
 
120 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00609094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02885  ankyrin-like protein  37.96 
 
 
1097 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  36.05 
 
 
870 aa  50.8  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  37.35 
 
 
790 aa  49.7  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  31.86 
 
 
347 aa  49.7  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  33.33 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  31.48 
 
 
427 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  38.95 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1663  FOG: Ankyrin repeat protein  39.58 
 
 
285 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.10004 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  38.16 
 
 
278 aa  49.7  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  32.71 
 
 
382 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  37.5 
 
 
450 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  32.46 
 
 
196 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  36.14 
 
 
216 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  32.46 
 
 
196 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  37.11 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  40.3 
 
 
293 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  43.16 
 
 
217 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  39.76 
 
 
723 aa  48.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  35.29 
 
 
226 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  32.46 
 
 
196 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1581  hypothetical protein  38.64 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  40.48 
 
 
426 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  35.56 
 
 
329 aa  48.1  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>