274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21100 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  100 
 
 
128 aa  254  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  68.6 
 
 
128 aa  163  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  62.38 
 
 
125 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  59.26 
 
 
130 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  55.36 
 
 
139 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  52.21 
 
 
135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  49.55 
 
 
178 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  50 
 
 
137 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  48.65 
 
 
178 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  57 
 
 
149 aa  103  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  50.45 
 
 
175 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  45.53 
 
 
170 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  48.6 
 
 
171 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  48.31 
 
 
136 aa  100  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  58.65 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  43.08 
 
 
172 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  41.54 
 
 
181 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  40.77 
 
 
181 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  55.56 
 
 
167 aa  97.8  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  47.52 
 
 
171 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  49.02 
 
 
187 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  42.31 
 
 
174 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  49.02 
 
 
187 aa  94.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  54.78 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  42.31 
 
 
174 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  41.04 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  40.77 
 
 
174 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  46.3 
 
 
132 aa  88.6  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  45.61 
 
 
174 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  43.1 
 
 
200 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  44.44 
 
 
194 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  43.52 
 
 
195 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  44.95 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  37.01 
 
 
173 aa  82  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  44.86 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  48.62 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  43.52 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  43.27 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  41.46 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  43.75 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  35.25 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  36.44 
 
 
162 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  36.29 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  40.54 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  36.29 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  39.84 
 
 
189 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  40.18 
 
 
187 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  40.48 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  38.74 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  37.17 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  40.74 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  36.67 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3252  AnkB protein  39.29 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103832  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1187  ankyrin repeat-containing protein  34.38 
 
 
188 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  39.22 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  36.59 
 
 
382 aa  60.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  41.67 
 
 
216 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3296  ankyrin  42.7 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172473 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  38.2 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  32 
 
 
217 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  40.22 
 
 
219 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  38.28 
 
 
190 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  36.54 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  38.04 
 
 
1099 aa  57.4  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  33.68 
 
 
185 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  33.68 
 
 
185 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02885  ankyrin-like protein  40 
 
 
1097 aa  57  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  34.4 
 
 
197 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  38.04 
 
 
1101 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  42.62 
 
 
278 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  33.04 
 
 
168 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  42.67 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  33.04 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  34.44 
 
 
855 aa  55.1  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  34.52 
 
 
192 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  35.05 
 
 
821 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  40.48 
 
 
442 aa  54.3  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  37.21 
 
 
442 aa  53.9  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  41.1 
 
 
426 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  37.21 
 
 
870 aa  53.9  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  37.21 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  44.93 
 
 
4520 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  36.05 
 
 
329 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  36.45 
 
 
344 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  42.53 
 
 
494 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  32.58 
 
 
293 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  35.53 
 
 
1249 aa  52  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  39.76 
 
 
287 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  37.21 
 
 
423 aa  52.4  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  32.48 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  33.33 
 
 
155 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0324  ankyrin repeat-containing protein  32.61 
 
 
142 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  41.67 
 
 
347 aa  52  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  33.33 
 
 
187 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2208  Ankyrin  32.58 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00294118  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35799  predicted protein  33.94 
 
 
168 aa  51.2  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0631  ankyrin repeat-containing protein  29.7 
 
 
504 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000258922  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  29.89 
 
 
1021 aa  50.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  37.65 
 
 
337 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>