More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1343 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  100 
 
 
178 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  94.94 
 
 
178 aa  335  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  80.38 
 
 
175 aa  258  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  71.97 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  57.06 
 
 
181 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  59.17 
 
 
172 aa  192  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  59.38 
 
 
181 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  59.01 
 
 
174 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  60.25 
 
 
174 aa  183  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  55.95 
 
 
174 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  60.53 
 
 
171 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  59.87 
 
 
171 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  57.14 
 
 
174 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  51.2 
 
 
173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  55.03 
 
 
174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  53.85 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  52.07 
 
 
194 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  56.58 
 
 
187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  56.58 
 
 
187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  52.07 
 
 
195 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  57.86 
 
 
176 aa  160  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  53.01 
 
 
192 aa  158  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  53.57 
 
 
135 aa  134  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  53.12 
 
 
125 aa  128  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  51.11 
 
 
137 aa  127  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  50.68 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  48.44 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  51.59 
 
 
136 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  42.64 
 
 
162 aa  112  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  42.28 
 
 
172 aa  111  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  35.71 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  39.68 
 
 
156 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  39.68 
 
 
156 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  39.68 
 
 
156 aa  105  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  42.28 
 
 
190 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  48.65 
 
 
128 aa  104  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  42.95 
 
 
145 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  46.85 
 
 
128 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  52.59 
 
 
140 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  40 
 
 
173 aa  100  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  50.89 
 
 
149 aa  101  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  38.31 
 
 
197 aa  99.8  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  41.77 
 
 
185 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  44.35 
 
 
132 aa  96.3  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  37.97 
 
 
197 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  35.62 
 
 
163 aa  95.5  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  43.48 
 
 
183 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  38.06 
 
 
201 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  39.04 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  44.2 
 
 
167 aa  91.7  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  34.72 
 
 
157 aa  89  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  36.57 
 
 
184 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  36.57 
 
 
189 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  34.53 
 
 
155 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  45.45 
 
 
138 aa  87.4  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  33.12 
 
 
173 aa  87  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  38.52 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  35.54 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  31.91 
 
 
217 aa  85.5  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  42.74 
 
 
122 aa  84.3  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  36.51 
 
 
426 aa  82.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  37.7 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  38.84 
 
 
223 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  32.93 
 
 
870 aa  81.6  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  35.56 
 
 
305 aa  81.3  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  44.17 
 
 
756 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1856  hypothetical protein  37.34 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.601822 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  31.54 
 
 
1030 aa  80.1  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  35.42 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  31.06 
 
 
347 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  35.95 
 
 
236 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  36.03 
 
 
483 aa  77.8  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  35.95 
 
 
236 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  32.59 
 
 
762 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  38.89 
 
 
235 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  31.29 
 
 
382 aa  77  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  32.9 
 
 
345 aa  77  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  35.29 
 
 
236 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  35.29 
 
 
236 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  35.29 
 
 
236 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  34.51 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  34.72 
 
 
1156 aa  75.9  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  38.1 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  36.52 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  34.64 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  32.89 
 
 
321 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  37.04 
 
 
1133 aa  74.7  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  30.72 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1844  ankyrin  34.32 
 
 
619 aa  74.7  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  30.72 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
240 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
235 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
235 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
235 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
235 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
242 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
242 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  32.28 
 
 
203 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  32.28 
 
 
203 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  32.28 
 
 
203 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>