More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5252 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  84.32 
 
 
183 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  69.4 
 
 
203 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  72.85 
 
 
201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  67.31 
 
 
187 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  58.64 
 
 
197 aa  209  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  58.06 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  58.55 
 
 
189 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  50.35 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  48.75 
 
 
203 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  51.25 
 
 
190 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  50.75 
 
 
203 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  50.75 
 
 
203 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  50.75 
 
 
203 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  40.12 
 
 
168 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1187  ankyrin repeat-containing protein  41.72 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  40.12 
 
 
168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  49.14 
 
 
154 aa  117  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  42.96 
 
 
192 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  49.02 
 
 
187 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  44.7 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3252  AnkB protein  43.7 
 
 
124 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103832  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  44.7 
 
 
163 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  46.27 
 
 
178 aa  104  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  46.32 
 
 
175 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  40.74 
 
 
181 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  42.86 
 
 
157 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  40.74 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  41.77 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  41.51 
 
 
186 aa  97.8  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  40.28 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  43.41 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  39.6 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  37.41 
 
 
172 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  43.28 
 
 
170 aa  95.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  39.74 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  39.58 
 
 
174 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  39.47 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  42.34 
 
 
174 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  41.61 
 
 
173 aa  94.4  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  40.46 
 
 
173 aa  94.4  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  36.81 
 
 
173 aa  91.3  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  45.74 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  38.19 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  42.98 
 
 
155 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  45.74 
 
 
139 aa  88.6  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  37.32 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  41.61 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  40.88 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  35.92 
 
 
171 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  40.88 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  42.64 
 
 
130 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  40.15 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  37.96 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  41.46 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  38.51 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  33.59 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  34.88 
 
 
2171 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  31.06 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  41.38 
 
 
870 aa  74.3  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  41.59 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  32.5 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  33.05 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  36.21 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  33.58 
 
 
494 aa  72.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  32.5 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  37.4 
 
 
305 aa  72  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  38.33 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  48 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  36.28 
 
 
382 aa  71.2  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  42.99 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  40 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  35.29 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  31.67 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2666  ankyrin  41.35 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.931958  hitchhiker  0.000000569803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  36.96 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.82 
 
 
1402 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  42.24 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  35.65 
 
 
954 aa  68.9  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  32.34 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  33.33 
 
 
715 aa  68.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  29.19 
 
 
1585 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  41.96 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  37.06 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  31.72 
 
 
1030 aa  67  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  29.07 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  36.36 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  33.87 
 
 
4520 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  37.5 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  28.57 
 
 
253 aa  67  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  30.18 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  32.82 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  29.49 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  32.82 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  36.54 
 
 
404 aa  65.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  37.4 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  31.11 
 
 
790 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  35.48 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  27.33 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  31.25 
 
 
891 aa  64.7  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>