238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1187 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1187  ankyrin repeat-containing protein  100 
 
 
188 aa  384  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  69.11 
 
 
154 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  50 
 
 
192 aa  154  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  50 
 
 
168 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  50 
 
 
168 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  51.94 
 
 
187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3252  AnkB protein  55.93 
 
 
124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103832  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  43.21 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  41.72 
 
 
185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  41.61 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  47.06 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  47.06 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  42.54 
 
 
184 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  43.55 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  46.22 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  37.39 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  37.39 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  37.39 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  32.64 
 
 
203 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  35.25 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  36 
 
 
125 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  33.91 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  35.77 
 
 
130 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  33.91 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  38.94 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  33.88 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  37.61 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  42.22 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  37.76 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  39.42 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  39.53 
 
 
395 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  36.75 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  33.64 
 
 
137 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  34.38 
 
 
128 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0582  ankyrin  32.06 
 
 
344 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  33.61 
 
 
163 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  33.33 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  28.57 
 
 
171 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  33.33 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  31.58 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  33.33 
 
 
128 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  27.78 
 
 
174 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  30.08 
 
 
494 aa  58.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  35.11 
 
 
195 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  34.29 
 
 
870 aa  58.2  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  26.98 
 
 
174 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  31.78 
 
 
346 aa  57.8  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  33.04 
 
 
132 aa  57.8  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  28.68 
 
 
135 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  35 
 
 
135 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  35.19 
 
 
382 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  27.21 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  30.18 
 
 
321 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  34.04 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  31.9 
 
 
584 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  37.36 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  26.98 
 
 
174 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  32.74 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  37.08 
 
 
192 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  35.37 
 
 
472 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0996  hypothetical protein  32.43 
 
 
447 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0836466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  34.55 
 
 
136 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  27.45 
 
 
172 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  30.95 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3561  Ankyrin  28.03 
 
 
331 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  27.61 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  31.31 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  28.91 
 
 
426 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  32.14 
 
 
1585 aa  54.3  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  36.08 
 
 
790 aa  54.3  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43531  predicted protein  30.39 
 
 
119 aa  53.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181933  normal  0.18997 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  39.71 
 
 
542 aa  53.1  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  29.1 
 
 
1005 aa  53.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  35.05 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  27.66 
 
 
1061 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  26.96 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  28.57 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2632  Ankyrin  30.12 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031209  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  30.09 
 
 
442 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  40.26 
 
 
490 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  38.46 
 
 
220 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  24.59 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  41.98 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1634  ankyrin repeat-containing protein  36.36 
 
 
1116 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0269822  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  29.58 
 
 
278 aa  52  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  29.75 
 
 
865 aa  52  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  32.65 
 
 
450 aa  51.6  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  31.25 
 
 
2171 aa  51.6  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  27.27 
 
 
954 aa  51.2  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2450  ankyrin repeat-containing protein  25.49 
 
 
300 aa  51.2  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  25.4 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  26.67 
 
 
891 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0361  ankyrin  34.15 
 
 
301 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0332017 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1581  hypothetical protein  31 
 
 
157 aa  50.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  29.6 
 
 
287 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  36.78 
 
 
258 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  32.5 
 
 
162 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48392  predicted protein  27.97 
 
 
352 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0270  ankyrin  27.59 
 
 
445 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>