More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2449 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  100 
 
 
155 aa  312  9e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  57.94 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  43.8 
 
 
163 aa  97.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  41.32 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  42.74 
 
 
173 aa  95.5  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  44 
 
 
200 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  38.58 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  44 
 
 
190 aa  92  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  42.19 
 
 
194 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  41.41 
 
 
195 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  40.98 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  42.98 
 
 
197 aa  90.1  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  40.98 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  42.98 
 
 
185 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  40 
 
 
174 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  40.62 
 
 
192 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  45.9 
 
 
162 aa  87  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  40.16 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  38.21 
 
 
175 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  36.15 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  40 
 
 
172 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  49.46 
 
 
490 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  36.15 
 
 
156 aa  84  6e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  36.89 
 
 
170 aa  84  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  41.67 
 
 
184 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  36.15 
 
 
156 aa  83.6  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  41.67 
 
 
183 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  40.5 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  38.21 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  40.83 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  37.7 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  37.7 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  40.83 
 
 
189 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  34.29 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  36.8 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  36.89 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  41.8 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  42.16 
 
 
1030 aa  79.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  37.7 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  38.21 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  37.7 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  37.29 
 
 
1585 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  38.38 
 
 
2171 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  44.79 
 
 
715 aa  77  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  36.36 
 
 
173 aa  77  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  36.89 
 
 
174 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  37.7 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  40.65 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  35.06 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  36.64 
 
 
711 aa  76.3  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  39.62 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  31.13 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  38.33 
 
 
203 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  41.13 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  35.77 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  39.84 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  35.77 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  35.77 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  39.68 
 
 
544 aa  72  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  34 
 
 
171 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0493  ankyrin  37.25 
 
 
254 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  36.07 
 
 
545 aa  70.9  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  38.33 
 
 
216 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  35.09 
 
 
154 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  34 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  38.74 
 
 
762 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  38.32 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  37.39 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  36.27 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  36.27 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  36.27 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  32.26 
 
 
329 aa  68.9  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0626  ankyrin repeat-containing protein  36.27 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  36.27 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  36.27 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.2 
 
 
2413 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  30.99 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  40.78 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  37.93 
 
 
426 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03775  conserved hypothetical protein  41 
 
 
307 aa  68.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.79 
 
 
1402 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0477  ankyrin repeat-containing protein  35.29 
 
 
290 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  36.27 
 
 
289 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  29.63 
 
 
382 aa  67.8  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0533  ankyrin repeat-containing protein  36.27 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0564  ankyrin repeat-containing protein  36.27 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  33.05 
 
 
347 aa  67.8  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  33.88 
 
 
217 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3277  ankyrin  41 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  33.06 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  33.06 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  42 
 
 
474 aa  67.4  0.00000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  35.35 
 
 
450 aa  67.4  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  43 
 
 
1021 aa  67  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  38.83 
 
 
855 aa  66.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  43.33 
 
 
790 aa  67  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  36.44 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  38.61 
 
 
427 aa  67  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  42.86 
 
 
1061 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2666  ankyrin  42 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.931958  hitchhiker  0.000000569803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>