More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2051 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  88.95 
 
 
181 aa  330  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  73.05 
 
 
172 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  67.84 
 
 
174 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  71.43 
 
 
174 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  68.71 
 
 
174 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  66.67 
 
 
174 aa  221  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  58.38 
 
 
171 aa  197  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  58.19 
 
 
178 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  57.8 
 
 
171 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  57.06 
 
 
178 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  57.49 
 
 
175 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  58.28 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  55.19 
 
 
173 aa  168  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  57.72 
 
 
170 aa  168  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  59.15 
 
 
176 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  54.37 
 
 
194 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  54.37 
 
 
200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  53.75 
 
 
195 aa  164  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  56.25 
 
 
187 aa  159  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  56.25 
 
 
187 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  50.91 
 
 
192 aa  158  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  45.03 
 
 
190 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  50.41 
 
 
125 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  40.6 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  42.4 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  44.53 
 
 
139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  45.53 
 
 
130 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  47.41 
 
 
135 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  47.2 
 
 
145 aa  104  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  36.49 
 
 
197 aa  100  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  45.05 
 
 
128 aa  99.4  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  38.36 
 
 
189 aa  99  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  40.74 
 
 
185 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  35.11 
 
 
156 aa  98.2  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  37.41 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  40.77 
 
 
128 aa  97.8  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  35.11 
 
 
156 aa  97.1  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  35.11 
 
 
156 aa  97.4  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  38.67 
 
 
161 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  39.26 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  37.16 
 
 
197 aa  95.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  37.78 
 
 
201 aa  94.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  36.24 
 
 
173 aa  94  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  40.31 
 
 
203 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  36.11 
 
 
157 aa  92.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  46.94 
 
 
137 aa  92  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  43.59 
 
 
122 aa  89  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  47.27 
 
 
149 aa  89  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  35.97 
 
 
155 aa  87  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  40.16 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  44.64 
 
 
136 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  37.21 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  34.87 
 
 
217 aa  85.9  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  50.63 
 
 
140 aa  85.5  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  37.8 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  33.57 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  33.57 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  36.61 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  34.56 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  34.9 
 
 
1030 aa  79.7  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  32.03 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  32.03 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  32.03 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  36.92 
 
 
132 aa  79  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  38.35 
 
 
490 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  38.03 
 
 
219 aa  77  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  36.43 
 
 
1099 aa  76.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  30 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  37.1 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  36.43 
 
 
1101 aa  75.5  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  40.8 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  34.56 
 
 
345 aa  74.7  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  31.43 
 
 
382 aa  74.3  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  33.57 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  30.56 
 
 
1061 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  30.49 
 
 
855 aa  73.2  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  33.59 
 
 
1585 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  36.24 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.25 
 
 
1402 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  31.61 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0662  ankyrin  35.25 
 
 
358 aa  72  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00179604  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  35.71 
 
 
870 aa  72  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  35.61 
 
 
1021 aa  72  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  36.8 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  32.28 
 
 
2171 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  36.94 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  32.64 
 
 
1156 aa  70.9  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
329 aa  70.9  0.000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  35.96 
 
 
223 aa  70.9  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  36 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  34.87 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  36.22 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  32.06 
 
 
762 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  34.59 
 
 
1133 aa  68.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  38.66 
 
 
711 aa  69.3  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  37.17 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  37.8 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  32.24 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  34.38 
 
 
646 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>