More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1860 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  88.95 
 
 		 181 aa  330  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  73.49 
 
 		 172 aa  241  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  68.45 
 
 		 174 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  70.73 
 
 		 174 aa  225  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  65.5 
 
 		 174 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  70.44 
 
 		 174 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  62.03 
 
 		 171 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  59.32 
 
 		 178 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  61.39 
 
 		 171 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  59.38 
 
 		 178 aa  191  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  58.54 
 
 		 175 aa  188  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  57.67 
 
 		 174 aa  181  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  53.25 
 
 		 194 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  53.25 
 
 		 200 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  60.14 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  51.45 
 
 		 195 aa  168  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  55.84 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  56.21 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  59.03 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  59.03 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  52.57 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  42.97 
 
 		 172 aa  117  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  50 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  43.4 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  48.78 
 
 		 130 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  46.72 
 
 		 139 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  43.2 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  48.8 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  37.16 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  47.1 
 
 		 135 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  40.74 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  36.64 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  38.82 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  36.64 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  36.64 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  41.54 
 
 		 128 aa  99  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  40 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  45.95 
 
 		 128 aa  98.6  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  39.26 
 
 		 201 aa  97.8  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  36.69 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  37.14 
 
 		 161 aa  95.9  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  35.42 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  39.53 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  40.31 
 
 		 203 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  35.29 
 
 		 217 aa  91.3  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  35.42 
 
 		 157 aa  90.9  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  47.92 
 
 		 137 aa  90.9  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  49.09 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  35.97 
 
 		 155 aa  89  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  44.8 
 
 		 122 aa  87.8  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  46.43 
 
 		 136 aa  87  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  37.21 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  46.46 
 
 		 140 aa  85.9  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  44.04 
 
 		 138 aa  85.9  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  37.7 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  39.52 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  32.47 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  32.47 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  32.47 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  38.58 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  35.71 
 
 		 404 aa  80.9  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  32.1 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  32.1 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  39.85 
 
 		 490 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  35.85 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  31.51 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  35.06 
 
 		 1030 aa  78.6  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  34.84 
 
 		 345 aa  78.6  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  34.53 
 
 		 1061 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  30.57 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  36.61 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  32.26 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  35.94 
 
 		 1585 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  32.14 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  35.14 
 
 		 870 aa  74.7  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  34.85 
 
 		 1156 aa  74.7  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  33.94 
 
 		 395 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  30.11 
 
 		 855 aa  73.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  30.46 
 
 		 2171 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  36.91 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  34.03 
 
 		 1133 aa  73.2  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  38.74 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  32.21 
 
 		 762 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  42.15 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  37.98 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  35 
 
 		 1099 aa  72.4  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  38.89 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0662  ankyrin  33.81 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00179604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  35.86 
 
 		 494 aa  72.4  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0198  ankyrin  37.62 
 
 		 170 aa  72  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0147609  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  34.23 
 
 		 711 aa  71.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  43.53 
 
 		 167 aa  72  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1402 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  35 
 
 		 1101 aa  71.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  31.79 
 
 		 479 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  33.78 
 
 		 337 aa  71.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  25 
 
 		 253 aa  71.2  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  40 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.9 
 
 		 2413 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>