More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2090 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  100 
 
 
176 aa  342  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  82.25 
 
 
174 aa  275  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  65.32 
 
 
200 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  65.32 
 
 
194 aa  216  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  64.74 
 
 
195 aa  214  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  62.29 
 
 
192 aa  197  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  61.01 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  58.08 
 
 
174 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  61.29 
 
 
175 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  59.15 
 
 
181 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  56.21 
 
 
181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  57.93 
 
 
174 aa  173  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  59.09 
 
 
178 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  57.93 
 
 
174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  57.93 
 
 
174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  56.55 
 
 
171 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  53.57 
 
 
172 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  52.69 
 
 
173 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  55.36 
 
 
171 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  62.77 
 
 
170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  59.59 
 
 
187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  59.59 
 
 
187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  54.76 
 
 
125 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  46.72 
 
 
172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  52.8 
 
 
135 aa  115  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  50 
 
 
190 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  53.6 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  54.4 
 
 
145 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  50.77 
 
 
130 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  53.97 
 
 
136 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  46.83 
 
 
137 aa  105  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  50 
 
 
132 aa  104  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  41.61 
 
 
183 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  56.18 
 
 
140 aa  97.8  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  38.16 
 
 
197 aa  97.8  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  41.61 
 
 
185 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  40.71 
 
 
173 aa  94  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  35.29 
 
 
156 aa  92  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  47.2 
 
 
167 aa  91.7  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  46.61 
 
 
128 aa  91.3  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  39.44 
 
 
201 aa  91.3  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  35.29 
 
 
156 aa  90.9  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  35.29 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  47.46 
 
 
128 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  49.57 
 
 
122 aa  88.2  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  38.93 
 
 
155 aa  87.8  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  38.69 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  35.77 
 
 
189 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  37.25 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  40.35 
 
 
162 aa  86.7  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  49.11 
 
 
149 aa  86.7  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  35.04 
 
 
184 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  46.02 
 
 
138 aa  85.1  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  39.84 
 
 
155 aa  84.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  37.14 
 
 
185 aa  84.3  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  37.14 
 
 
185 aa  84.3  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  33.93 
 
 
197 aa  84.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  37.96 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  36.11 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  37.1 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  36.76 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  40.14 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  40.46 
 
 
222 aa  79  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  38.97 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912311 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  35.04 
 
 
1030 aa  77  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  32.97 
 
 
274 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  34 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  38.97 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  40.8 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  40.8 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  37.09 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  40.8 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  40.8 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  40.8 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  40.8 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  40.8 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  37.5 
 
 
855 aa  75.1  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  35.88 
 
 
404 aa  74.7  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  39.67 
 
 
870 aa  74.7  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  37.69 
 
 
223 aa  74.3  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  38.24 
 
 
236 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  38.24 
 
 
236 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  38.24 
 
 
236 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  35.04 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  38.64 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  34.01 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  40.8 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  43.12 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1844  ankyrin  41.01 
 
 
619 aa  72.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  38.64 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  34 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  36.09 
 
 
427 aa  72.8  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  35.4 
 
 
442 aa  72  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  33.6 
 
 
450 aa  71.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  33.33 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  33.33 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  38.6 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  33.33 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  35.56 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  40.48 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>