More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5249 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  100 
 
 
190 aa  370  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  47.56 
 
 
203 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  51.25 
 
 
185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  47.3 
 
 
157 aa  127  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  45.09 
 
 
203 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  47.06 
 
 
161 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  46.85 
 
 
197 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  48.12 
 
 
183 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  45.03 
 
 
181 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  49.65 
 
 
201 aa  121  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  48.03 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  45.39 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  45.39 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  48.03 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  48.03 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  47.65 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  51.45 
 
 
174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  45.57 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  46.1 
 
 
195 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  45.45 
 
 
194 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  43.4 
 
 
181 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  47.37 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  48.57 
 
 
174 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  47.86 
 
 
174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  43.62 
 
 
178 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  40.61 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  45.65 
 
 
192 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  41.77 
 
 
172 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  45.39 
 
 
174 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  45.39 
 
 
174 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  44.44 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  43.38 
 
 
173 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  42.28 
 
 
178 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  39.49 
 
 
163 aa  104  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  50 
 
 
176 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  43.66 
 
 
173 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  44.62 
 
 
170 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  43.24 
 
 
173 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  45.39 
 
 
171 aa  99  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  44.68 
 
 
171 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  44.85 
 
 
187 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  44.85 
 
 
187 aa  94  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  44.74 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  44 
 
 
155 aa  92  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  40.88 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  50 
 
 
870 aa  90.1  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  47.66 
 
 
208 aa  88.2  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  38.96 
 
 
855 aa  85.5  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  36.49 
 
 
762 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  40.95 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  40.4 
 
 
426 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  34.64 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  36.08 
 
 
305 aa  82  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  37.95 
 
 
490 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  45.76 
 
 
1030 aa  81.3  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.26 
 
 
1402 aa  81.3  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  38.19 
 
 
4520 aa  81.3  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  36.62 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  38.98 
 
 
168 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  38.98 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3533  Ankyrin  42.45 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.254367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  46.55 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  39.81 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  43.8 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3277  ankyrin  38.13 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  39.22 
 
 
337 aa  78.2  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  39.33 
 
 
756 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  33.99 
 
 
404 aa  77  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  35.48 
 
 
790 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  38.06 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  39.23 
 
 
140 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  37.33 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  31.21 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  35.59 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  38.17 
 
 
1156 aa  75.9  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  34.11 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  44.26 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  34.11 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  33.56 
 
 
1585 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  34.11 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  34.78 
 
 
2171 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  46.02 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  36.44 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
469 aa  72.4  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  33.09 
 
 
711 aa  72.8  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  32.81 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  39.2 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  38.71 
 
 
1249 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3252  AnkB protein  37.84 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103832  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  37.01 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  33.6 
 
 
162 aa  72  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  37.01 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  33.14 
 
 
427 aa  72  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3421  Ankyrin  36.53 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175263  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0198  ankyrin  41.41 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0147609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  36.31 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  35 
 
 
266 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1581  hypothetical protein  44.86 
 
 
157 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  26.67 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  40.8 
 
 
125 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>