More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0378 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  43.51 
 
 
187 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  43.06 
 
 
197 aa  104  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  42.66 
 
 
157 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  45.39 
 
 
189 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  43.15 
 
 
201 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  44.68 
 
 
184 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  43.06 
 
 
203 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  35.05 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  41.51 
 
 
185 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  39.61 
 
 
163 aa  95.1  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  43.57 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  42.67 
 
 
162 aa  94.4  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  39.6 
 
 
161 aa  92  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  40.88 
 
 
190 aa  90.5  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  36.48 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  36.48 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  36.48 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  36.43 
 
 
203 aa  84.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  34.48 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  33.85 
 
 
1585 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
954 aa  79.3  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  35.92 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  35.21 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  34.87 
 
 
155 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  37.5 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  34.51 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  37.82 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  40.65 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  36.84 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  36.15 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  37.12 
 
 
494 aa  75.5  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  42.31 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  42.31 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  34.31 
 
 
2171 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  35.51 
 
 
293 aa  74.7  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  32.24 
 
 
762 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  37.16 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  35.82 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  35.62 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  35.25 
 
 
174 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  36.18 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  30.19 
 
 
321 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  31.97 
 
 
472 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  28.39 
 
 
382 aa  71.2  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0245  ankyrin repeat protein  31.3 
 
 
851 aa  70.9  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  35.37 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1949  ankyrin repeat-containing protein  31.3 
 
 
611 aa  70.5  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.144324  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  37.72 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  38 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  35.25 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  31.69 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  35.34 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  34.86 
 
 
715 aa  69.3  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  33.33 
 
 
427 aa  69.3  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  32.24 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  38.73 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  36.09 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  36.36 
 
 
426 aa  68.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  32.58 
 
 
750 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  31.36 
 
 
483 aa  68.2  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04190  palmitoyltransferase, putative  32.61 
 
 
776 aa  67.8  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  32.24 
 
 
1030 aa  67.4  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  34.46 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  35.34 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  30.97 
 
 
490 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  30.26 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  26.49 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  33.33 
 
 
1005 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3163  Ankyrin  33.11 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  34.15 
 
 
1061 aa  65.5  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  35.92 
 
 
855 aa  64.7  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  33.54 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  32.03 
 
 
296 aa  64.7  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.43 
 
 
1402 aa  64.3  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  31.21 
 
 
404 aa  63.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  37.61 
 
 
395 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  37.09 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  31.82 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_8694  predicted protein  36.55 
 
 
145 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.827941  normal  0.680946 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.19 
 
 
2413 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0471  Ankyrin  28.29 
 
 
249 aa  63.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  31.97 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  36.52 
 
 
154 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  34.88 
 
 
450 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  32.09 
 
 
140 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4067  ankyrin  37.11 
 
 
495 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  29.3 
 
 
646 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0324  ankyrin repeat-containing protein  41.49 
 
 
142 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  28.17 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  28.17 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  30.3 
 
 
219 aa  62.4  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  34.04 
 
 
247 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  32.58 
 
 
345 aa  62  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  31.54 
 
 
541 aa  62  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  35.38 
 
 
261 aa  62  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2259  ankyrin repeat-containing signal peptide protein  33.33 
 
 
250 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980373  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  26.9 
 
 
723 aa  62  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_1452  predicted protein  31.91 
 
 
493 aa  61.2  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0338335  normal  0.137357 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  31.01 
 
 
144 aa  61.6  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>