More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0781 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  100 
 
 		 261 aa  511  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0728  Ankyrin  84.85 
 
 		 264 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.365587  normal  0.800826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0798  aankyrin repeat-containing protein  84.09 
 
 		 264 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  54.36 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  50.45 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2345  Ankyrin  49.76 
 
 		 233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0071  ankyrin repeat-containing protein  50 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  50.79 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0493  ankyrin  46.11 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  46.46 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  50.53 
 
 		 210 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  47.47 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  48.02 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  41.36 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32350  hypothetical protein  48.68 
 
 		 210 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4030  Ankyrin  46.07 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.147969 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  41.45 
 
 		 196 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  41.27 
 
 		 196 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  41.45 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  41.45 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  40.93 
 
 		 196 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  41.45 
 
 		 196 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0477  ankyrin repeat-containing protein  40 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1663  FOG: Ankyrin repeat protein  49.43 
 
 		 285 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.10004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3296  ankyrin  43.39 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172473 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  38.42 
 
 		 290 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0626  ankyrin repeat-containing protein  38.42 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  35.05 
 
 		 234 aa  141  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  38.42 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  37.89 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  38.42 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  37.89 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  37.89 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0533  ankyrin repeat-containing protein  37.89 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0564  ankyrin repeat-containing protein  37.89 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0349  ankyrin repeat-containing protein  39.06 
 
 		 201 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0382  ankyrin repeat protein  39.06 
 
 		 201 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.415795 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3145  ankyrin  37.5 
 
 		 201 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000605686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3305  ankyrin  38.54 
 
 		 201 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0337  ankyrin repeat-containing protein  38.54 
 
 		 201 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00274  predicted transcriptional regulator with ankyrin domain  38.54 
 
 		 201 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3288  Ankyrin  38.54 
 
 		 201 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00277  hypothetical protein  38.54 
 
 		 201 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.568599  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0379  ankyrin repeat-containing protein  38.02 
 
 		 201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.89591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0925  conserved hypothetical protein; ankyrin repeateat; putative exported protein  40.56 
 
 		 224 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2944  Ankyrin  40.7 
 
 		 455 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000965114  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0149  ankyrin  43.59 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  45.1 
 
 		 176 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4103  ankyrin  41.05 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0645  Ankyrin  43.57 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2793  Ankyrin  43.09 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176695  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  36.9 
 
 		 1156 aa  105  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2632  Ankyrin  32.26 
 
 		 210 aa  102  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031209  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  36.02 
 
 		 305 aa  99  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3814  Ankyrin  39.73 
 
 		 173 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  37.56 
 
 		 426 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  32.62 
 
 		 217 aa  92.4  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  33.5 
 
 		 427 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  34.15 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0428  Ankyrin  30.51 
 
 		 222 aa  90.5  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  35.75 
 
 		 216 aa  89.7  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  32.96 
 
 		 404 aa  89.4  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  35.48 
 
 		 222 aa  88.6  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  28.93 
 
 		 382 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  37.37 
 
 		 490 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  34.36 
 
 		 2171 aa  87.4  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1585 aa  86.3  5e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  33.5 
 
 		 494 aa  86.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  34.22 
 
 		 321 aa  85.5  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  31.22 
 
 		 329 aa  85.1  9e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  38.17 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  30.68 
 
 		 715 aa  83.2  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  32.2 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  36.36 
 
 		 870 aa  82  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  31.16 
 
 		 1030 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.49 
 
 		 1402 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  35.29 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  33.16 
 
 		 762 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  29.02 
 
 		 479 aa  79  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  36.11 
 
 		 855 aa  79  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  34.18 
 
 		 337 aa  78.6  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  33.68 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  30.18 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  34.5 
 
 		 1061 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  29 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  36.76 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  41.18 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  30.58 
 
 		 723 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  29.26 
 
 		 954 aa  75.5  0.0000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1581  hypothetical protein  35.06 
 
 		 157 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2481  Ankyrin  28.65 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000229526  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  29.51 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1453  TPR domain-containing protein  29.67 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157912  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.44 
 
 		 2413 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  37.04 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0471  Ankyrin  24.87 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  35.46 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  30 
 
 		 790 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03267  conserved hypothetical protein  34.81 
 
 		 766 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.104781  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  34.78 
 
 		 1622 aa  70.5  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>