More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3006 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  100 
 
 
222 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  44.32 
 
 
274 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  43.66 
 
 
220 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  37.02 
 
 
395 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  35.27 
 
 
490 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  34.78 
 
 
305 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  35.89 
 
 
216 aa  95.9  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  36.26 
 
 
1061 aa  95.5  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  31.98 
 
 
1030 aa  95.5  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  40.59 
 
 
194 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0963  ankyrin  35.82 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  33.01 
 
 
423 aa  94  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  40 
 
 
195 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  31.53 
 
 
762 aa  93.2  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0291  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  31.79 
 
 
224 aa  92.8  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.461089  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  33.15 
 
 
2171 aa  91.7  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  33.52 
 
 
287 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  30.65 
 
 
1585 aa  90.5  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.87 
 
 
2413 aa  89.7  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  39.16 
 
 
200 aa  89  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  35.38 
 
 
870 aa  88.2  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  31.46 
 
 
1156 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  32.72 
 
 
544 aa  87  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  39.16 
 
 
426 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  33.14 
 
 
278 aa  86.7  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  32.78 
 
 
293 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  36.36 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  34.29 
 
 
173 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  31.91 
 
 
954 aa  85.5  6e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0728  Ankyrin  36.17 
 
 
264 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.365587  normal  0.800826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  31.9 
 
 
494 aa  85.5  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.74 
 
 
1402 aa  85.1  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0798  aankyrin repeat-containing protein  36.17 
 
 
264 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  31.64 
 
 
427 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  40.76 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  31.89 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0582  ankyrin  33.33 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  34.26 
 
 
1133 aa  82.4  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  28.43 
 
 
382 aa  82.4  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  34.24 
 
 
442 aa  81.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  32.83 
 
 
474 aa  81.3  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  32.8 
 
 
157 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  33.04 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  37.7 
 
 
855 aa  80.5  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  29.69 
 
 
891 aa  80.1  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  33.71 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  35.33 
 
 
541 aa  80.1  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  32.19 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  36 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0493  ankyrin  31.79 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  34.29 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  37.14 
 
 
556 aa  79.7  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0382  ankyrin repeat protein  28.5 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.415795 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  30.65 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0324  ankyrin repeat-containing protein  36.51 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1144  hypothetical protein  30.43 
 
 
2122 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  33.13 
 
 
469 aa  78.6  0.00000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  36.84 
 
 
590 aa  79  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  36.14 
 
 
192 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0379  ankyrin repeat-containing protein  28.5 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.89591  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  31.21 
 
 
723 aa  78.2  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  34.46 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  31.67 
 
 
404 aa  78.2  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  33.52 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  31.73 
 
 
931 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  33.97 
 
 
1005 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00274  predicted transcriptional regulator with ankyrin domain  27.98 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3288  Ankyrin  27.98 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  33.17 
 
 
227 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  30.94 
 
 
640 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00277  hypothetical protein  27.98 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.568599  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0337  ankyrin repeat-containing protein  27.98 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3305  ankyrin  27.98 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  32.6 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  31.28 
 
 
811 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  31.02 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  34.36 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  30.81 
 
 
479 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0270  ankyrin  31.91 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  30.2 
 
 
646 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0349  ankyrin repeat-containing protein  27.98 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  31.79 
 
 
347 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  31.02 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  29.28 
 
 
483 aa  75.5  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  32.96 
 
 
821 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  33.68 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  30.94 
 
 
1198 aa  74.7  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  33.54 
 
 
174 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  31.71 
 
 
483 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2666  ankyrin  36.09 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.931958  hitchhiker  0.000000569803 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  34.42 
 
 
1622 aa  73.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  30.3 
 
 
1249 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  29.28 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4030  Ankyrin  34.88 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.147969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  42.86 
 
 
135 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  32.54 
 
 
865 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  32.63 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  29.69 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  31.79 
 
 
750 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  32.7 
 
 
472 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>