More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3876 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  100 
 
 		 174 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  97.13 
 
 		 174 aa  330  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  91.95 
 
 		 174 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  91.38 
 
 		 174 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  71.43 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  70.73 
 
 		 181 aa  225  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  64.85 
 
 		 172 aa  209  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  56.55 
 
 		 178 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  55.95 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  59.15 
 
 		 200 aa  181  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  57.67 
 
 		 194 aa  179  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  57.67 
 
 		 195 aa  178  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  59.06 
 
 		 174 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  58.11 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  57.4 
 
 		 171 aa  171  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  54.6 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  56.21 
 
 		 171 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  53.8 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  57.93 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  57.34 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  57.34 
 
 		 187 aa  157  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  53.9 
 
 		 170 aa  154  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  42.54 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  45.19 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  48.48 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  45.39 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  46.88 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  37.68 
 
 		 156 aa  104  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  45.6 
 
 		 130 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  44.74 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  37.68 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  37.68 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  48 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  39.1 
 
 		 161 aa  98.6  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  41.09 
 
 		 187 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  40.28 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  36.91 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  42.31 
 
 		 128 aa  94.4  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  45.9 
 
 		 135 aa  94  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  41.09 
 
 		 183 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  44.85 
 
 		 149 aa  90.9  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  38.67 
 
 		 203 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  37.21 
 
 		 184 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  53.41 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  36.43 
 
 		 189 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  37.96 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  36.64 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  55.13 
 
 		 140 aa  88.2  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  34.57 
 
 		 217 aa  87.8  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  37.98 
 
 		 197 aa  87.4  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  45.37 
 
 		 128 aa  87  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  37.23 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  37.23 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  37.23 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  44.79 
 
 		 137 aa  85.1  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  38.62 
 
 		 216 aa  85.1  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  34.51 
 
 		 203 aa  84.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  37.21 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  39.53 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  45.05 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  33.57 
 
 		 855 aa  79.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  37.04 
 
 		 426 aa  77.8  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  36.89 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  39.85 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  33.85 
 
 		 2171 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  37.21 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  38.66 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  37.98 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  29.73 
 
 		 382 aa  75.1  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  44.44 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  39.09 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  34.07 
 
 		 404 aa  74.3  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  30.77 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  30.77 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  37.17 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  36.11 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  36.43 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  38.28 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  36.52 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  31.35 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  38.1 
 
 		 870 aa  69.7  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  35.51 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1402 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3533  Ankyrin  38.97 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.254367  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  38.46 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  33.83 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  38.73 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3408  ankyrin  33.33 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.90032  normal  0.939091 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  31.76 
 
 		 762 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  31.54 
 
 		 469 aa  68.6  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  31.37 
 
 		 1061 aa  68.2  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  38.6 
 
 		 236 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  31.03 
 
 		 347 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  37.72 
 
 		 236 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3421  Ankyrin  31.79 
 
 		 197 aa  67.4  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  37.72 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  36.89 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  36.89 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  36.89 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  35.51 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>