More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5600 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  340  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  71.43 
 
 		 175 aa  206  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  71.43 
 
 		 178 aa  205  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  71.43 
 
 		 178 aa  204  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  59.6 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  57.32 
 
 		 181 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  53.09 
 
 		 171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  54.82 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  62.32 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  59.29 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  57.14 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  57.05 
 
 		 174 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  52.41 
 
 		 194 aa  156  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  53.7 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  51.81 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  63.04 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  55.17 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  55.13 
 
 		 174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  50.71 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  52.47 
 
 		 174 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  53.1 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  53.1 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  50.85 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  42.31 
 
 		 172 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  46.38 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  41.04 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  46.15 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  39.39 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  39.39 
 
 		 156 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  40.44 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  39.39 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  45.53 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  44.36 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  43.18 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  48.21 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  45.69 
 
 		 130 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  47.01 
 
 		 145 aa  98.2  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  38.85 
 
 		 155 aa  97.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  37.67 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  40.15 
 
 		 137 aa  97.1  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  42.54 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  37.14 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  40.58 
 
 		 201 aa  94.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  43.28 
 
 		 185 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  43.75 
 
 		 140 aa  94  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  37.41 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  41.67 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  39.39 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  40.65 
 
 		 217 aa  90.1  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  41.09 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  36.96 
 
 		 197 aa  87.4  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  47.66 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  35.62 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  35.42 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  39.53 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  41.32 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  42.19 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  41.38 
 
 		 870 aa  85.1  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  36.89 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  33.81 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  39.39 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  34.9 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.497005 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 		 1030 aa  80.1  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  34.9 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  34.9 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1856  hypothetical protein  40.31 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  36.36 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  38.46 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  38.89 
 
 		 404 aa  78.6  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  39.32 
 
 		 2171 aa  77.8  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  34.31 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  32.09 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  39.32 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  38.79 
 
 		 479 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  36.72 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  35.29 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  39.67 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  36.72 
 
 		 821 aa  74.7  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  38.17 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  33.08 
 
 		 210 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0428  Ankyrin  38.46 
 
 		 222 aa  74.3  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  34.65 
 
 		 329 aa  74.3  0.0000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  38.46 
 
 		 490 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  36.15 
 
 		 203 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  37.6 
 
 		 711 aa  73.9  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1402 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  34.48 
 
 		 545 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  36.36 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  38.94 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0324  ankyrin repeat-containing protein  39.66 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  38.94 
 
 		 225 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  36.23 
 
 		 186 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  29.94 
 
 		 427 aa  72.4  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  37.12 
 
 		 194 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  35.25 
 
 		 762 aa  72  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  36.23 
 
 		 1133 aa  71.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  28.57 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  37.07 
 
 		 395 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  36.43 
 
 		 483 aa  70.9  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  39.67 
 
 		 756 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>