More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1834 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  340  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  97.13 
 
 		 174 aa  330  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  91.95 
 
 		 174 aa  313  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  90.23 
 
 		 174 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  67.84 
 
 		 181 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  68.45 
 
 		 181 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  64.24 
 
 		 172 aa  210  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  59.01 
 
 		 178 aa  184  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  58.39 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  57.23 
 
 		 200 aa  178  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  56.63 
 
 		 194 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  56.63 
 
 		 195 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  57.83 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  58.54 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  56.76 
 
 		 175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  54.27 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  57.32 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  52.63 
 
 		 192 aa  164  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  58.74 
 
 		 187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  58.74 
 
 		 187 aa  160  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  57.93 
 
 		 176 aa  160  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  55.41 
 
 		 170 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  38.71 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  44.44 
 
 		 201 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  45.39 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  46.88 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  48.48 
 
 		 139 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  38.41 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  38.41 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  44.74 
 
 		 162 aa  103  9e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  38.41 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  45.6 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  48.8 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  38.35 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  40.31 
 
 		 187 aa  94.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  39.58 
 
 		 185 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  42.31 
 
 		 128 aa  94.4  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  45.9 
 
 		 135 aa  93.6  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  35.57 
 
 		 173 aa  91.3  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  54.55 
 
 		 122 aa  91.3  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  35.37 
 
 		 197 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  37.5 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  40.31 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  36.43 
 
 		 184 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  38.76 
 
 		 197 aa  89  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  35.66 
 
 		 189 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  37.96 
 
 		 203 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  37.96 
 
 		 203 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  37.96 
 
 		 203 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  41.09 
 
 		 203 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  44.12 
 
 		 149 aa  87.8  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  55.13 
 
 		 140 aa  87.4  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  45.37 
 
 		 128 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  35.21 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  33.95 
 
 		 217 aa  86.3  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  43.4 
 
 		 137 aa  85.9  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  37.93 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  36.5 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  39.53 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  45.05 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  37.78 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  33.11 
 
 		 855 aa  78.6  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  37.7 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  34.33 
 
 		 427 aa  78.6  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  37.98 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  38.66 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  30.77 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  30.77 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  39.1 
 
 		 490 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  36.76 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  44.44 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  40.14 
 
 		 220 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  33.08 
 
 		 2171 aa  74.3  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  29.14 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  38.6 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  35.65 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  32.86 
 
 		 404 aa  71.2  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  35.34 
 
 		 346 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  34.72 
 
 		 321 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  37.5 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  36.52 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  38 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  34.56 
 
 		 1030 aa  69.3  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  37.5 
 
 		 870 aa  68.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  38.6 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  33.83 
 
 		 305 aa  68.2  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 762 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  37.72 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  37.72 
 
 		 236 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3533  Ankyrin  38.24 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.254367  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1856  hypothetical protein  36.84 
 
 		 208 aa  67.4  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  35.21 
 
 		 293 aa  67.4  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  37.82 
 
 		 240 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  37.82 
 
 		 235 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  30.43 
 
 		 222 aa  67  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  31.54 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  37.82 
 
 		 235 aa  67  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.04 
 
 		 1402 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  37.82 
 
 		 242 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  37.72 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>