201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4179 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  100 
 
 
132 aa  258  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  57.81 
 
 
136 aa  136  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  56.03 
 
 
125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  48.51 
 
 
135 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  55.14 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  52.59 
 
 
122 aa  111  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  51.35 
 
 
137 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  47.11 
 
 
139 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  45.76 
 
 
138 aa  100  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  45.67 
 
 
187 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  45.67 
 
 
187 aa  100  9e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  51.35 
 
 
145 aa  100  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  59.8 
 
 
140 aa  98.6  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  44.35 
 
 
178 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  46.85 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  43.55 
 
 
175 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  50 
 
 
176 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  43.8 
 
 
178 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  50 
 
 
167 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  46.46 
 
 
174 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  46.3 
 
 
128 aa  88.6  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  42.52 
 
 
194 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  41.32 
 
 
170 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  40.77 
 
 
200 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  41.73 
 
 
195 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  44.44 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  39.5 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  42.62 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  38.58 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  42.62 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  36.92 
 
 
181 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  39.5 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  38.76 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  38.66 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  38.66 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  35.04 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  35.16 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  38.66 
 
 
174 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  33.08 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  34.19 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  37.4 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  33.08 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  36.52 
 
 
197 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  33.08 
 
 
156 aa  67  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  34.15 
 
 
184 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  36.59 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  46.51 
 
 
1099 aa  62  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  34.38 
 
 
203 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  35.14 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  46.51 
 
 
1101 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  33.33 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02885  ankyrin-like protein  41.59 
 
 
1097 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  34.78 
 
 
201 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1187  ankyrin repeat-containing protein  33.04 
 
 
188 aa  57.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  41.3 
 
 
194 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  39.34 
 
 
190 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  31.68 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  31.68 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  33.67 
 
 
192 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  34.48 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  34.96 
 
 
203 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  34.96 
 
 
203 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  34.96 
 
 
203 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  31.63 
 
 
187 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  34 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  34 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  35.65 
 
 
442 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  40 
 
 
490 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  33.04 
 
 
187 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  39.66 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  44.09 
 
 
208 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  38.67 
 
 
450 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  34.21 
 
 
173 aa  52  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3252  AnkB protein  31.63 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103832  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0645  Ankyrin  35.04 
 
 
240 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0428  Ankyrin  31.2 
 
 
222 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  38.2 
 
 
203 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0988  ankyrin  31.86 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0503606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3905  Ankyrin  38.94 
 
 
1112 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1581  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  50.8  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  35 
 
 
197 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  36.08 
 
 
483 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  42.5 
 
 
287 aa  50.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  39.53 
 
 
196 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9151  predicted protein  35.87 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00609094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  36.13 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03775  conserved hypothetical protein  41.67 
 
 
307 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  37.5 
 
 
395 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2411  Ankyrin  32.67 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.020704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  34.88 
 
 
442 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  38.2 
 
 
821 aa  48.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  36.27 
 
 
870 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  40.43 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  31.52 
 
 
891 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  31.18 
 
 
253 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  38.2 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  40.23 
 
 
494 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  32.14 
 
 
426 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  41.67 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  35.71 
 
 
404 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>